Protein–RNA interactions for Protein: Q16549

PCSK7, Proprotein convertase subtilisin/kexin type 7, humanhuman

Predictions only

Length 785 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCSK7Q16549 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PCSK7Q16549 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PCSK7Q16549 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PCSK7Q16549 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PCSK7Q16549 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PCSK7Q16549 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PCSK7Q16549 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PCSK7Q16549 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PCSK7Q16549 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PCSK7Q16549 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PCSK7Q16549 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PCSK7Q16549 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PCSK7Q16549 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PCSK7Q16549 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PCSK7Q16549 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PCSK7Q16549 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PCSK7Q16549 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PCSK7Q16549 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PCSK7Q16549 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PCSK7Q16549 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
PCSK7Q16549 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PCSK7Q16549 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PCSK7Q16549 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PCSK7Q16549 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PCSK7Q16549 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PCSK7Q16549 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PCSK7Q16549 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PCSK7Q16549 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PCSK7Q16549 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PCSK7Q16549 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PCSK7Q16549 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PCSK7Q16549 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PCSK7Q16549 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PCSK7Q16549 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PCSK7Q16549 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PCSK7Q16549 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PCSK7Q16549 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PCSK7Q16549 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
PCSK7Q16549 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PCSK7Q16549 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PCSK7Q16549 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PCSK7Q16549 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
PCSK7Q16549 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PCSK7Q16549 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
PCSK7Q16549 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
PCSK7Q16549 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PCSK7Q16549 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PCSK7Q16549 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PCSK7Q16549 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PCSK7Q16549 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PCSK7Q16549 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PCSK7Q16549 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PCSK7Q16549 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PCSK7Q16549 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PCSK7Q16549 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PCSK7Q16549 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PCSK7Q16549 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PCSK7Q16549 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PCSK7Q16549 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PCSK7Q16549 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PCSK7Q16549 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PCSK7Q16549 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PCSK7Q16549 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PCSK7Q16549 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PCSK7Q16549 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PCSK7Q16549 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PCSK7Q16549 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PCSK7Q16549 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PCSK7Q16549 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PCSK7Q16549 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PCSK7Q16549 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PCSK7Q16549 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PCSK7Q16549 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PCSK7Q16549 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PCSK7Q16549 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PCSK7Q16549 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PCSK7Q16549 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PCSK7Q16549 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PCSK7Q16549 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PCSK7Q16549 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
PCSK7Q16549 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
PCSK7Q16549 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PCSK7Q16549 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
PCSK7Q16549 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PCSK7Q16549 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PCSK7Q16549 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PCSK7Q16549 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PCSK7Q16549 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PCSK7Q16549 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PCSK7Q16549 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PCSK7Q16549 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PCSK7Q16549 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PCSK7Q16549 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
PCSK7Q16549 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PCSK7Q16549 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PCSK7Q16549 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PCSK7Q16549 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PCSK7Q16549 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PCSK7Q16549 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PCSK7Q16549 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.2 ms