Protein–RNA interactions for Protein: Q16204

CCDC6, Coiled-coil domain-containing protein 6, humanhuman

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Length 474 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC6Q16204 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CCDC6Q16204 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
CCDC6Q16204 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CCDC6Q16204 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
CCDC6Q16204 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CCDC6Q16204 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CCDC6Q16204 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CCDC6Q16204 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CCDC6Q16204 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CCDC6Q16204 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CCDC6Q16204 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CCDC6Q16204 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
CCDC6Q16204 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CCDC6Q16204 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CCDC6Q16204 GOPC-203ENST00000535237 4460 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CCDC6Q16204 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CCDC6Q16204 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CCDC6Q16204 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CCDC6Q16204 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CCDC6Q16204 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CCDC6Q16204 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CCDC6Q16204 IPPK-201ENST00000287996 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CCDC6Q16204 CTXND1-201ENST00000560778 6890 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CCDC6Q16204 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CCDC6Q16204 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CCDC6Q16204 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CCDC6Q16204 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CCDC6Q16204 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CCDC6Q16204 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CCDC6Q16204 AC239800.3-201ENST00000424684 5243 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CCDC6Q16204 CASR-202ENST00000498619 5009 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CCDC6Q16204 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CCDC6Q16204 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CCDC6Q16204 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CCDC6Q16204 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CCDC6Q16204 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CCDC6Q16204 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CCDC6Q16204 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CCDC6Q16204 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CCDC6Q16204 LINC00351-201ENST00000424926 911 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CCDC6Q16204 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
CCDC6Q16204 DICER1-AS1-202ENST00000439819 810 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CCDC6Q16204 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CCDC6Q16204 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
CCDC6Q16204 SLC25A30-AS1-201ENST00000506633 701 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CCDC6Q16204 MRPL36-204ENST00000508987 686 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CCDC6Q16204 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CCDC6Q16204 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CCDC6Q16204 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CCDC6Q16204 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CCDC6Q16204 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CCDC6Q16204 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CCDC6Q16204 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CCDC6Q16204 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CCDC6Q16204 MPP6-201ENST00000222644 8452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CCDC6Q16204 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CCDC6Q16204 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CCDC6Q16204 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CCDC6Q16204 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CCDC6Q16204 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CCDC6Q16204 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CCDC6Q16204 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CCDC6Q16204 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CCDC6Q16204 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CCDC6Q16204 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CCDC6Q16204 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CCDC6Q16204 PHLDB1-223ENST00000600882 5479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CCDC6Q16204 NANOS1-202ENST00000425699 4017 ntAPPRIS P2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CCDC6Q16204 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CCDC6Q16204 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CCDC6Q16204 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CCDC6Q16204 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CCDC6Q16204 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CCDC6Q16204 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CCDC6Q16204 HS6ST3-201ENST00000376705 7804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CCDC6Q16204 ABCA7-201ENST00000263094 6816 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CCDC6Q16204 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
CCDC6Q16204 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CCDC6Q16204 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CCDC6Q16204 KMT2E-201ENST00000257745 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CCDC6Q16204 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CCDC6Q16204 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CCDC6Q16204 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CCDC6Q16204 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CCDC6Q16204 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CCDC6Q16204 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CCDC6Q16204 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CCDC6Q16204 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CCDC6Q16204 CRB3P1-201ENST00000449338 276 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
CCDC6Q16204 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CCDC6Q16204 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CCDC6Q16204 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CCDC6Q16204 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CCDC6Q16204 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CCDC6Q16204 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
CCDC6Q16204 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CCDC6Q16204 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
CCDC6Q16204 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CCDC6Q16204 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CCDC6Q16204 MOXD1-202ENST00000367963 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
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