Protein–RNA interactions for Protein: Q15642

TRIP10, Cdc42-interacting protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 601 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIP10Q15642 RPS6KL1-210ENST00000555647 3309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRIP10Q15642 NPHP4-201ENST00000378156 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRIP10Q15642 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRIP10Q15642 RBM26-203ENST00000438737 4132 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRIP10Q15642 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRIP10Q15642 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRIP10Q15642 TMEM38A-201ENST00000187762 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRIP10Q15642 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRIP10Q15642 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRIP10Q15642 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
TRIP10Q15642 TMEM200C-202ENST00000581347 10638 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRIP10Q15642 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRIP10Q15642 DDX56-201ENST00000258772 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRIP10Q15642 CSRNP2-201ENST00000228515 4471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRIP10Q15642 PARP10-201ENST00000313028 3497 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRIP10Q15642 GPAT2-202ENST00000434632 3061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRIP10Q15642 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRIP10Q15642 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRIP10Q15642 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRIP10Q15642 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRIP10Q15642 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
TRIP10Q15642 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRIP10Q15642 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
TRIP10Q15642 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRIP10Q15642 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRIP10Q15642 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRIP10Q15642 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRIP10Q15642 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRIP10Q15642 POU5F1B-201ENST00000465342 5360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRIP10Q15642 ZNF70-201ENST00000341976 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRIP10Q15642 PEX26-205ENST00000610387 3924 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRIP10Q15642 TGFB1-201ENST00000221930 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRIP10Q15642 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRIP10Q15642 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRIP10Q15642 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRIP10Q15642 DMTN-205ENST00000432128 2508 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRIP10Q15642 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRIP10Q15642 GDF11-201ENST00000257868 8657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRIP10Q15642 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRIP10Q15642 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRIP10Q15642 ASIC4-201ENST00000347842 2684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRIP10Q15642 UHRF1-204ENST00000616255 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRIP10Q15642 RALGDS-201ENST00000372047 3598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRIP10Q15642 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIP10Q15642 SLCO4C1-201ENST00000310954 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIP10Q15642 MED20-201ENST00000265350 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIP10Q15642 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIP10Q15642 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIP10Q15642 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIP10Q15642 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIP10Q15642 SYT9-201ENST00000318881 3955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIP10Q15642 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIP10Q15642 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIP10Q15642 FSIP1-201ENST00000350221 2805 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIP10Q15642 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIP10Q15642 IGFBP5-201ENST00000233813 6215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIP10Q15642 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIP10Q15642 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIP10Q15642 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIP10Q15642 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIP10Q15642 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIP10Q15642 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIP10Q15642 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIP10Q15642 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIP10Q15642 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIP10Q15642 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIP10Q15642 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIP10Q15642 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIP10Q15642 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIP10Q15642 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIP10Q15642 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIP10Q15642 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIP10Q15642 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIP10Q15642 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIP10Q15642 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIP10Q15642 COL11A2-202ENST00000361917 6104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIP10Q15642 HAND2-AS1-202ENST00000502896 5278 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIP10Q15642 RABIF-201ENST00000367262 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIP10Q15642 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIP10Q15642 TAF6-201ENST00000344095 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIP10Q15642 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIP10Q15642 SLC35C2-204ENST00000372230 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIP10Q15642 AC138028.2-202ENST00000567968 4528 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIP10Q15642 SRSF2-203ENST00000392485 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIP10Q15642 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIP10Q15642 SAFB-202ENST00000454510 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIP10Q15642 GAD2-201ENST00000259271 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIP10Q15642 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIP10Q15642 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIP10Q15642 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIP10Q15642 ALDH1B1-201ENST00000377698 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIP10Q15642 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIP10Q15642 RNF222-202ENST00000399398 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIP10Q15642 CAMK2D-205ENST00000394524 5294 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIP10Q15642 NAALADL1-203ENST00000356632 2118 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIP10Q15642 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIP10Q15642 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIP10Q15642 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIP10Q15642 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIP10Q15642 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.8 ms