Protein–RNA interactions for Protein: Q15628

TRADD, Tumor necrosis factor receptor type 1-associated DEATH domain protein, humanhuman

Predictions only

Length 312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRADDQ15628 AC139749.1-202ENST00000617529 3139 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
TRADDQ15628 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRADDQ15628 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.26
TRADDQ15628 LINC00552-201ENST00000625151 2579 ntBASIC16.71■□□□□ 0.26
TRADDQ15628 C6orf120-201ENST00000332290 2667 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.26
TRADDQ15628 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
TRADDQ15628 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.26
TRADDQ15628 RHPN1-201ENST00000289013 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
TRADDQ15628 SALL3-201ENST00000536229 3997 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRADDQ15628 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRADDQ15628 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRADDQ15628 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRADDQ15628 PLEKHN1-203ENST00000379410 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRADDQ15628 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRADDQ15628 SPATA20-201ENST00000006658 2719 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRADDQ15628 CHFR-204ENST00000443047 2990 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRADDQ15628 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRADDQ15628 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRADDQ15628 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRADDQ15628 IFT52-201ENST00000373030 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRADDQ15628 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRADDQ15628 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRADDQ15628 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRADDQ15628 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRADDQ15628 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
TRADDQ15628 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRADDQ15628 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRADDQ15628 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
TRADDQ15628 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRADDQ15628 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
TRADDQ15628 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRADDQ15628 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRADDQ15628 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRADDQ15628 USP28-214ENST00000545540 3431 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRADDQ15628 MED16-203ENST00000325464 2922 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRADDQ15628 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRADDQ15628 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRADDQ15628 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
TRADDQ15628 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRADDQ15628 BTBD11-204ENST00000420571 3478 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRADDQ15628 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRADDQ15628 PPHLN1-201ENST00000256678 1820 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRADDQ15628 FABP1-202ENST00000393750 1839 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRADDQ15628 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRADDQ15628 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRADDQ15628 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRADDQ15628 ARIH2-205ENST00000449376 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRADDQ15628 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRADDQ15628 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRADDQ15628 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRADDQ15628 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
TRADDQ15628 ABCG4-205ENST00000619701 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRADDQ15628 FAM110C-201ENST00000327669 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRADDQ15628 KCNT1-211ENST00000491806 3678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRADDQ15628 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRADDQ15628 FAM219A-204ENST00000379081 3543 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRADDQ15628 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRADDQ15628 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
TRADDQ15628 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRADDQ15628 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRADDQ15628 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
TRADDQ15628 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRADDQ15628 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRADDQ15628 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRADDQ15628 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
TRADDQ15628 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
TRADDQ15628 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRADDQ15628 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRADDQ15628 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRADDQ15628 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRADDQ15628 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
TRADDQ15628 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRADDQ15628 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
TRADDQ15628 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRADDQ15628 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRADDQ15628 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRADDQ15628 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRADDQ15628 ALG1-204ENST00000588623 2671 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRADDQ15628 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRADDQ15628 FMR1-203ENST00000370470 1774 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRADDQ15628 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRADDQ15628 ZBED1-201ENST00000381218 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRADDQ15628 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRADDQ15628 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRADDQ15628 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRADDQ15628 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRADDQ15628 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRADDQ15628 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRADDQ15628 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TRADDQ15628 MCM3AP-AS1-203ENST00000421927 2280 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TRADDQ15628 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TRADDQ15628 KCNG4-202ENST00000568181 2199 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TRADDQ15628 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TRADDQ15628 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TRADDQ15628 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
TRADDQ15628 GRB2-201ENST00000316615 3181 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TRADDQ15628 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TRADDQ15628 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
TRADDQ15628 VARS2-211ENST00000541562 3566 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TRADDQ15628 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.3 ms