Protein–RNA interactions for Protein: Q14050

COL9A3, Collagen alpha-3(IX) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 684 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL9A3Q14050 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
COL9A3Q14050 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
COL9A3Q14050 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
COL9A3Q14050 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
COL9A3Q14050 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
COL9A3Q14050 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
COL9A3Q14050 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
COL9A3Q14050 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
COL9A3Q14050 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
COL9A3Q14050 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
COL9A3Q14050 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
COL9A3Q14050 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
COL9A3Q14050 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
COL9A3Q14050 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
COL9A3Q14050 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
COL9A3Q14050 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
COL9A3Q14050 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
COL9A3Q14050 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
COL9A3Q14050 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
COL9A3Q14050 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
COL9A3Q14050 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
COL9A3Q14050 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
COL9A3Q14050 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
COL9A3Q14050 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
COL9A3Q14050 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
COL9A3Q14050 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
COL9A3Q14050 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
COL9A3Q14050 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
COL9A3Q14050 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
COL9A3Q14050 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
COL9A3Q14050 CPSF7-202ENST00000394888 3650 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
COL9A3Q14050 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
COL9A3Q14050 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
COL9A3Q14050 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
COL9A3Q14050 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
COL9A3Q14050 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
COL9A3Q14050 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
COL9A3Q14050 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
COL9A3Q14050 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
COL9A3Q14050 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
COL9A3Q14050 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
COL9A3Q14050 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
COL9A3Q14050 MAGI1-216ENST00000497477 3555 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
COL9A3Q14050 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
COL9A3Q14050 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
COL9A3Q14050 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
COL9A3Q14050 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
COL9A3Q14050 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
COL9A3Q14050 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
COL9A3Q14050 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
COL9A3Q14050 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
COL9A3Q14050 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC18.85■□□□□ 0.61
COL9A3Q14050 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
COL9A3Q14050 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
COL9A3Q14050 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
COL9A3Q14050 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
COL9A3Q14050 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC18.85■□□□□ 0.61
COL9A3Q14050 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
COL9A3Q14050 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
COL9A3Q14050 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
COL9A3Q14050 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
COL9A3Q14050 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
COL9A3Q14050 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
COL9A3Q14050 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
COL9A3Q14050 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
COL9A3Q14050 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
COL9A3Q14050 FLOT2-201ENST00000394906 2756 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
COL9A3Q14050 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
COL9A3Q14050 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
COL9A3Q14050 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
COL9A3Q14050 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
COL9A3Q14050 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
COL9A3Q14050 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
COL9A3Q14050 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
COL9A3Q14050 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
COL9A3Q14050 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
COL9A3Q14050 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
COL9A3Q14050 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
COL9A3Q14050 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
COL9A3Q14050 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC18.84■□□□□ 0.61
COL9A3Q14050 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
COL9A3Q14050 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
COL9A3Q14050 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
COL9A3Q14050 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
COL9A3Q14050 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
COL9A3Q14050 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
COL9A3Q14050 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
COL9A3Q14050 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
COL9A3Q14050 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
COL9A3Q14050 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
COL9A3Q14050 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
COL9A3Q14050 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
COL9A3Q14050 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
COL9A3Q14050 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
COL9A3Q14050 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
COL9A3Q14050 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
COL9A3Q14050 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
COL9A3Q14050 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
COL9A3Q14050 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
COL9A3Q14050 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.8 ms