Protein–RNA interactions for Protein: Q14028

CNGB1, Cyclic nucleotide-gated cation channel beta-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,251 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGB1Q14028 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CNGB1Q14028 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CNGB1Q14028 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CNGB1Q14028 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CNGB1Q14028 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CNGB1Q14028 KCNMA1-219ENST00000480683 2963 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CNGB1Q14028 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CNGB1Q14028 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CNGB1Q14028 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CNGB1Q14028 ITGAV-201ENST00000261023 7030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CNGB1Q14028 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CNGB1Q14028 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CNGB1Q14028 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CNGB1Q14028 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CNGB1Q14028 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CNGB1Q14028 MYH11-211ENST00000576790 6272 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CNGB1Q14028 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CNGB1Q14028 LMAN1-201ENST00000251047 5521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CNGB1Q14028 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CNGB1Q14028 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CNGB1Q14028 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CNGB1Q14028 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CNGB1Q14028 DNAJC21-202ENST00000382021 6208 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CNGB1Q14028 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
CNGB1Q14028 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
CNGB1Q14028 AGPS-201ENST00000264167 7764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CNGB1Q14028 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CNGB1Q14028 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
CNGB1Q14028 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CNGB1Q14028 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CNGB1Q14028 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CNGB1Q14028 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CNGB1Q14028 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
CNGB1Q14028 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CNGB1Q14028 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CNGB1Q14028 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CNGB1Q14028 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CNGB1Q14028 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CNGB1Q14028 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CNGB1Q14028 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CNGB1Q14028 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CNGB1Q14028 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CNGB1Q14028 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CNGB1Q14028 VARS2-201ENST00000321897 4073 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CNGB1Q14028 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CNGB1Q14028 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CNGB1Q14028 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CNGB1Q14028 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CNGB1Q14028 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CNGB1Q14028 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CNGB1Q14028 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CNGB1Q14028 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CNGB1Q14028 NACAD-202ENST00000490531 4780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CNGB1Q14028 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
CNGB1Q14028 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CNGB1Q14028 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CNGB1Q14028 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CNGB1Q14028 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CNGB1Q14028 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CNGB1Q14028 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
CNGB1Q14028 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CNGB1Q14028 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CNGB1Q14028 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CNGB1Q14028 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CNGB1Q14028 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
CNGB1Q14028 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CNGB1Q14028 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
CNGB1Q14028 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
CNGB1Q14028 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CNGB1Q14028 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CNGB1Q14028 SLC4A3-202ENST00000317151 4069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CNGB1Q14028 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CNGB1Q14028 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CNGB1Q14028 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CNGB1Q14028 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CNGB1Q14028 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CNGB1Q14028 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
CNGB1Q14028 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CNGB1Q14028 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CNGB1Q14028 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CNGB1Q14028 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CNGB1Q14028 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CNGB1Q14028 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CNGB1Q14028 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CNGB1Q14028 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CNGB1Q14028 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CNGB1Q14028 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CNGB1Q14028 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CNGB1Q14028 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CNGB1Q14028 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CNGB1Q14028 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CNGB1Q14028 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CNGB1Q14028 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CNGB1Q14028 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CNGB1Q14028 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CNGB1Q14028 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CNGB1Q14028 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
CNGB1Q14028 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CNGB1Q14028 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CNGB1Q14028 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
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