Protein–RNA interactions for Protein: Q13733

ATP1A4, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit alpha-4, humanhuman

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Length 1,029 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP1A4Q13733 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATP1A4Q13733 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATP1A4Q13733 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATP1A4Q13733 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATP1A4Q13733 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATP1A4Q13733 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
ATP1A4Q13733 PALLD-215ENST00000512127 2958 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATP1A4Q13733 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATP1A4Q13733 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATP1A4Q13733 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATP1A4Q13733 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATP1A4Q13733 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATP1A4Q13733 VARS2-201ENST00000321897 4073 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATP1A4Q13733 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATP1A4Q13733 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATP1A4Q13733 GRB2-201ENST00000316615 3181 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATP1A4Q13733 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATP1A4Q13733 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATP1A4Q13733 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATP1A4Q13733 UBE3A-227ENST00000638011 8742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATP1A4Q13733 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATP1A4Q13733 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATP1A4Q13733 SH2D3C-206ENST00000429553 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATP1A4Q13733 GPD1L-201ENST00000282541 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATP1A4Q13733 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATP1A4Q13733 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATP1A4Q13733 BCAR1-204ENST00000418647 3387 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATP1A4Q13733 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATP1A4Q13733 JRK-209ENST00000612905 9124 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATP1A4Q13733 LINC00639-201ENST00000553932 4496 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATP1A4Q13733 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATP1A4Q13733 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATP1A4Q13733 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATP1A4Q13733 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATP1A4Q13733 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATP1A4Q13733 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATP1A4Q13733 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATP1A4Q13733 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATP1A4Q13733 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
ATP1A4Q13733 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATP1A4Q13733 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
ATP1A4Q13733 USP25-201ENST00000285679 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATP1A4Q13733 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATP1A4Q13733 PAPOLA-223ENST00000557320 3264 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATP1A4Q13733 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATP1A4Q13733 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATP1A4Q13733 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATP1A4Q13733 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATP1A4Q13733 PDP1-201ENST00000297598 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATP1A4Q13733 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATP1A4Q13733 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATP1A4Q13733 HSPH1-201ENST00000320027 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATP1A4Q13733 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATP1A4Q13733 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATP1A4Q13733 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATP1A4Q13733 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATP1A4Q13733 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATP1A4Q13733 STAT5A-211ENST00000590949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATP1A4Q13733 SYT5-201ENST00000354308 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATP1A4Q13733 MICAL1-201ENST00000358577 3142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ATP1A4Q13733 PKN1-202ENST00000342216 2960 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ATP1A4Q13733 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ATP1A4Q13733 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ATP1A4Q13733 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ATP1A4Q13733 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
ATP1A4Q13733 JPH4-201ENST00000356300 4278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ATP1A4Q13733 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
ATP1A4Q13733 FAM8A1-201ENST00000259963 4677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ATP1A4Q13733 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ATP1A4Q13733 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ATP1A4Q13733 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ATP1A4Q13733 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ATP1A4Q13733 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ATP1A4Q13733 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ATP1A4Q13733 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ATP1A4Q13733 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ATP1A4Q13733 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ATP1A4Q13733 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ATP1A4Q13733 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ATP1A4Q13733 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ATP1A4Q13733 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ATP1A4Q13733 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ATP1A4Q13733 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
ATP1A4Q13733 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ATP1A4Q13733 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ATP1A4Q13733 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ATP1A4Q13733 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ATP1A4Q13733 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ATP1A4Q13733 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ATP1A4Q13733 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ATP1A4Q13733 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ATP1A4Q13733 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ATP1A4Q13733 IGSF1-204ENST00000370903 4594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ATP1A4Q13733 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ATP1A4Q13733 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ATP1A4Q13733 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ATP1A4Q13733 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ATP1A4Q13733 AL669918.1-201ENST00000452392 2705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ATP1A4Q13733 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ATP1A4Q13733 AIFM2-202ENST00000373248 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
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