Protein–RNA interactions for Protein: Q13702

RAPSN, 43 kDa receptor-associated protein of the synapse, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAPSNQ13702 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAPSNQ13702 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
RAPSNQ13702 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAPSNQ13702 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAPSNQ13702 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAPSNQ13702 COX20P2-201ENST00000452636 358 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
RAPSNQ13702 AL391069.3-201ENST00000455503 618 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAPSNQ13702 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
RAPSNQ13702 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAPSNQ13702 CFL1-212ENST00000531413 636 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAPSNQ13702 HMGA2-210ENST00000541363 8094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAPSNQ13702 LINC02387-201ENST00000541749 868 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAPSNQ13702 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAPSNQ13702 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAPSNQ13702 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAPSNQ13702 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAPSNQ13702 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
RAPSNQ13702 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAPSNQ13702 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAPSNQ13702 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAPSNQ13702 ARAP2-201ENST00000303965 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAPSNQ13702 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAPSNQ13702 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAPSNQ13702 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAPSNQ13702 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAPSNQ13702 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAPSNQ13702 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAPSNQ13702 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAPSNQ13702 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAPSNQ13702 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAPSNQ13702 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAPSNQ13702 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAPSNQ13702 KCTD7-206ENST00000639828 5951 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAPSNQ13702 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAPSNQ13702 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAPSNQ13702 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAPSNQ13702 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAPSNQ13702 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAPSNQ13702 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAPSNQ13702 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAPSNQ13702 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAPSNQ13702 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAPSNQ13702 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAPSNQ13702 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAPSNQ13702 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAPSNQ13702 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAPSNQ13702 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAPSNQ13702 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAPSNQ13702 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAPSNQ13702 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAPSNQ13702 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAPSNQ13702 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
RAPSNQ13702 INGX-202ENST00000489074 768 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
RAPSNQ13702 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAPSNQ13702 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAPSNQ13702 AC004846.2-201ENST00000556578 777 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAPSNQ13702 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAPSNQ13702 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
RAPSNQ13702 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
RAPSNQ13702 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAPSNQ13702 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAPSNQ13702 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAPSNQ13702 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAPSNQ13702 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAPSNQ13702 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAPSNQ13702 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
RAPSNQ13702 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAPSNQ13702 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
RAPSNQ13702 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
RAPSNQ13702 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
RAPSNQ13702 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAPSNQ13702 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAPSNQ13702 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAPSNQ13702 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAPSNQ13702 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAPSNQ13702 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAPSNQ13702 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAPSNQ13702 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAPSNQ13702 SHROOM2-201ENST00000380913 7447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAPSNQ13702 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
RAPSNQ13702 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
RAPSNQ13702 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
RAPSNQ13702 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
RAPSNQ13702 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
RAPSNQ13702 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
RAPSNQ13702 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
RAPSNQ13702 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
RAPSNQ13702 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
RAPSNQ13702 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RAPSNQ13702 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RAPSNQ13702 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RAPSNQ13702 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RAPSNQ13702 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RAPSNQ13702 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RAPSNQ13702 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RAPSNQ13702 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RAPSNQ13702 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RAPSNQ13702 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RAPSNQ13702 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
RAPSNQ13702 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
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