Protein–RNA interactions for Protein: Q13609

DNASE1L3, Deoxyribonuclease gamma, humanhuman

Predictions only

Length 305 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNASE1L3Q13609 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
DNASE1L3Q13609 RN7SL204P-201ENST00000582831 262 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
DNASE1L3Q13609 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
DNASE1L3Q13609 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
DNASE1L3Q13609 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
DNASE1L3Q13609 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
DNASE1L3Q13609 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
DNASE1L3Q13609 OARD1-216ENST00000628419 1188 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
DNASE1L3Q13609 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
DNASE1L3Q13609 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
DNASE1L3Q13609 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
DNASE1L3Q13609 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
DNASE1L3Q13609 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
DNASE1L3Q13609 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
DNASE1L3Q13609 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
DNASE1L3Q13609 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
DNASE1L3Q13609 SLC25A27-201ENST00000371347 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
DNASE1L3Q13609 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
DNASE1L3Q13609 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
DNASE1L3Q13609 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
DNASE1L3Q13609 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
DNASE1L3Q13609 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
DNASE1L3Q13609 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
DNASE1L3Q13609 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
DNASE1L3Q13609 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
DNASE1L3Q13609 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
DNASE1L3Q13609 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
DNASE1L3Q13609 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
DNASE1L3Q13609 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
DNASE1L3Q13609 ZNF212-201ENST00000335870 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
DNASE1L3Q13609 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
DNASE1L3Q13609 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
DNASE1L3Q13609 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
DNASE1L3Q13609 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
DNASE1L3Q13609 INPP5K-201ENST00000320345 2880 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
DNASE1L3Q13609 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
DNASE1L3Q13609 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
DNASE1L3Q13609 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
DNASE1L3Q13609 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
DNASE1L3Q13609 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
DNASE1L3Q13609 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
DNASE1L3Q13609 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
DNASE1L3Q13609 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
DNASE1L3Q13609 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
DNASE1L3Q13609 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
DNASE1L3Q13609 SNCA-205ENST00000394991 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
DNASE1L3Q13609 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
DNASE1L3Q13609 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
DNASE1L3Q13609 UGT1A2P-201ENST00000454886 866 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
DNASE1L3Q13609 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
DNASE1L3Q13609 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
DNASE1L3Q13609 AC097493.3-201ENST00000509725 367 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
DNASE1L3Q13609 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
DNASE1L3Q13609 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC15.64■□□□□ 0.09
DNASE1L3Q13609 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
DNASE1L3Q13609 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
DNASE1L3Q13609 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
DNASE1L3Q13609 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
DNASE1L3Q13609 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
DNASE1L3Q13609 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
DNASE1L3Q13609 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
DNASE1L3Q13609 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
DNASE1L3Q13609 C15orf52-202ENST00000397536 4717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
DNASE1L3Q13609 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
DNASE1L3Q13609 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
DNASE1L3Q13609 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
DNASE1L3Q13609 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
DNASE1L3Q13609 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
DNASE1L3Q13609 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
DNASE1L3Q13609 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
DNASE1L3Q13609 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
DNASE1L3Q13609 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
DNASE1L3Q13609 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
DNASE1L3Q13609 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
DNASE1L3Q13609 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
DNASE1L3Q13609 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
DNASE1L3Q13609 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
DNASE1L3Q13609 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
DNASE1L3Q13609 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
DNASE1L3Q13609 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
DNASE1L3Q13609 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
DNASE1L3Q13609 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
DNASE1L3Q13609 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
DNASE1L3Q13609 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
DNASE1L3Q13609 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
DNASE1L3Q13609 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
DNASE1L3Q13609 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
DNASE1L3Q13609 PNKD-204ENST00000436005 978 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
DNASE1L3Q13609 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
DNASE1L3Q13609 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
DNASE1L3Q13609 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
DNASE1L3Q13609 AC055854.1-201ENST00000523627 570 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
DNASE1L3Q13609 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
DNASE1L3Q13609 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
DNASE1L3Q13609 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
DNASE1L3Q13609 IFT20-209ENST00000579419 787 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
DNASE1L3Q13609 ZNF628-203ENST00000598519 3847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
DNASE1L3Q13609 YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 718 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
DNASE1L3Q13609 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
DNASE1L3Q13609 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.4 ms