Protein–RNA interactions for Protein: Q13547

HDAC1, Histone deacetylase 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 482 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC1Q13547 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
HDAC1Q13547 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
HDAC1Q13547 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
HDAC1Q13547 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
HDAC1Q13547 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
HDAC1Q13547 AC023157.3-201ENST00000619086 2088 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
HDAC1Q13547 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
HDAC1Q13547 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
HDAC1Q13547 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
HDAC1Q13547 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
HDAC1Q13547 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
HDAC1Q13547 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
HDAC1Q13547 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
HDAC1Q13547 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
HDAC1Q13547 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
HDAC1Q13547 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
HDAC1Q13547 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
HDAC1Q13547 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
HDAC1Q13547 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
HDAC1Q13547 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
HDAC1Q13547 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
HDAC1Q13547 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
HDAC1Q13547 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
HDAC1Q13547 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
HDAC1Q13547 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
HDAC1Q13547 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
HDAC1Q13547 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
HDAC1Q13547 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
HDAC1Q13547 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
HDAC1Q13547 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
HDAC1Q13547 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
HDAC1Q13547 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
HDAC1Q13547 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
HDAC1Q13547 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
HDAC1Q13547 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
HDAC1Q13547 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
HDAC1Q13547 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
HDAC1Q13547 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
HDAC1Q13547 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
HDAC1Q13547 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
HDAC1Q13547 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
HDAC1Q13547 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
HDAC1Q13547 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
HDAC1Q13547 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
HDAC1Q13547 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
HDAC1Q13547 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
HDAC1Q13547 AC112693.3-201ENST00000624819 1983 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
HDAC1Q13547 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
HDAC1Q13547 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
HDAC1Q13547 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
HDAC1Q13547 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
HDAC1Q13547 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
HDAC1Q13547 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
HDAC1Q13547 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
HDAC1Q13547 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
HDAC1Q13547 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
HDAC1Q13547 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
HDAC1Q13547 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
HDAC1Q13547 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
HDAC1Q13547 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
HDAC1Q13547 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
HDAC1Q13547 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
HDAC1Q13547 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
HDAC1Q13547 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
HDAC1Q13547 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
HDAC1Q13547 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
HDAC1Q13547 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
HDAC1Q13547 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
HDAC1Q13547 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
HDAC1Q13547 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
HDAC1Q13547 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
HDAC1Q13547 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
HDAC1Q13547 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
HDAC1Q13547 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
HDAC1Q13547 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
HDAC1Q13547 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
HDAC1Q13547 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
HDAC1Q13547 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
HDAC1Q13547 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
HDAC1Q13547 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
HDAC1Q13547 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
HDAC1Q13547 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
HDAC1Q13547 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
HDAC1Q13547 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
HDAC1Q13547 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
HDAC1Q13547 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
HDAC1Q13547 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
HDAC1Q13547 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
HDAC1Q13547 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
HDAC1Q13547 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
HDAC1Q13547 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
HDAC1Q13547 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
HDAC1Q13547 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
HDAC1Q13547 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
HDAC1Q13547 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
HDAC1Q13547 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
HDAC1Q13547 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
HDAC1Q13547 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
HDAC1Q13547 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
HDAC1Q13547 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
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