Protein–RNA interactions for Protein: Q13461

FOXE3, Forkhead box protein E3, humanhuman

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Length 319 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXE3Q13461 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
FOXE3Q13461 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
FOXE3Q13461 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
FOXE3Q13461 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
FOXE3Q13461 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
FOXE3Q13461 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
FOXE3Q13461 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
FOXE3Q13461 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
FOXE3Q13461 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
FOXE3Q13461 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
FOXE3Q13461 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
FOXE3Q13461 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
FOXE3Q13461 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
FOXE3Q13461 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
FOXE3Q13461 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
FOXE3Q13461 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
FOXE3Q13461 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
FOXE3Q13461 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
FOXE3Q13461 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
FOXE3Q13461 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
FOXE3Q13461 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
FOXE3Q13461 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
FOXE3Q13461 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
FOXE3Q13461 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
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FOXE3Q13461 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
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FOXE3Q13461 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
FOXE3Q13461 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
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FOXE3Q13461 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
FOXE3Q13461 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
FOXE3Q13461 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
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FOXE3Q13461 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
FOXE3Q13461 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
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FOXE3Q13461 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
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FOXE3Q13461 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
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FOXE3Q13461 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
FOXE3Q13461 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
FOXE3Q13461 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
FOXE3Q13461 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
FOXE3Q13461 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
FOXE3Q13461 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
FOXE3Q13461 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
FOXE3Q13461 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
FOXE3Q13461 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
FOXE3Q13461 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
FOXE3Q13461 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
FOXE3Q13461 UHRF2-201ENST00000276893 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
FOXE3Q13461 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
FOXE3Q13461 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
FOXE3Q13461 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
FOXE3Q13461 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
FOXE3Q13461 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
FOXE3Q13461 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
FOXE3Q13461 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
FOXE3Q13461 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
FOXE3Q13461 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
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