Protein–RNA interactions for Protein: Q12805

EFEMP1, EGF-containing fibulin-like extracellular matrix protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFEMP1Q12805 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
EFEMP1Q12805 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC16.72■□□□□ 0.27
EFEMP1Q12805 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
EFEMP1Q12805 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
EFEMP1Q12805 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
EFEMP1Q12805 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
EFEMP1Q12805 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
EFEMP1Q12805 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
EFEMP1Q12805 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
EFEMP1Q12805 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
EFEMP1Q12805 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
EFEMP1Q12805 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
EFEMP1Q12805 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
EFEMP1Q12805 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
EFEMP1Q12805 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
EFEMP1Q12805 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
EFEMP1Q12805 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
EFEMP1Q12805 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
EFEMP1Q12805 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
EFEMP1Q12805 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
EFEMP1Q12805 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
EFEMP1Q12805 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
EFEMP1Q12805 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
EFEMP1Q12805 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
EFEMP1Q12805 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
EFEMP1Q12805 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
EFEMP1Q12805 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
EFEMP1Q12805 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
EFEMP1Q12805 AC008278.1-201ENST00000431117 568 ntTSL 4 BASIC16.71■□□□□ 0.27
EFEMP1Q12805 SERBP1P5-201ENST00000510079 1181 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
EFEMP1Q12805 AC106795.3-201ENST00000511650 547 ntTSL 4 BASIC16.71■□□□□ 0.27
EFEMP1Q12805 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
EFEMP1Q12805 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
EFEMP1Q12805 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
EFEMP1Q12805 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
EFEMP1Q12805 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
EFEMP1Q12805 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
EFEMP1Q12805 AC008761.3-201ENST00000624803 892 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
EFEMP1Q12805 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
EFEMP1Q12805 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
EFEMP1Q12805 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
EFEMP1Q12805 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
EFEMP1Q12805 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
EFEMP1Q12805 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
EFEMP1Q12805 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
EFEMP1Q12805 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
EFEMP1Q12805 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
EFEMP1Q12805 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
EFEMP1Q12805 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.26
EFEMP1Q12805 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
EFEMP1Q12805 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
EFEMP1Q12805 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
EFEMP1Q12805 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
EFEMP1Q12805 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
EFEMP1Q12805 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
EFEMP1Q12805 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
EFEMP1Q12805 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
EFEMP1Q12805 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
EFEMP1Q12805 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
EFEMP1Q12805 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
EFEMP1Q12805 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
EFEMP1Q12805 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
EFEMP1Q12805 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
EFEMP1Q12805 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
EFEMP1Q12805 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
EFEMP1Q12805 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
EFEMP1Q12805 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
EFEMP1Q12805 FAM207CP-201ENST00000443486 507 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
EFEMP1Q12805 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
EFEMP1Q12805 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
EFEMP1Q12805 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
EFEMP1Q12805 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
EFEMP1Q12805 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
EFEMP1Q12805 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
EFEMP1Q12805 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
EFEMP1Q12805 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
EFEMP1Q12805 MRNIP-225ENST00000610475 810 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
EFEMP1Q12805 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
EFEMP1Q12805 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
EFEMP1Q12805 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
EFEMP1Q12805 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
EFEMP1Q12805 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
EFEMP1Q12805 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
EFEMP1Q12805 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
EFEMP1Q12805 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
EFEMP1Q12805 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
EFEMP1Q12805 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
EFEMP1Q12805 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
EFEMP1Q12805 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
EFEMP1Q12805 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
EFEMP1Q12805 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
EFEMP1Q12805 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
EFEMP1Q12805 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
EFEMP1Q12805 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
EFEMP1Q12805 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
EFEMP1Q12805 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
EFEMP1Q12805 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
EFEMP1Q12805 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
EFEMP1Q12805 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
EFEMP1Q12805 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.4 ms