Protein–RNA interactions for Protein: Q02577

NHLH2, Helix-loop-helix protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 135 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NHLH2Q02577 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
NHLH2Q02577 KIF1A-201ENST00000320389 8832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
NHLH2Q02577 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
NHLH2Q02577 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
NHLH2Q02577 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
NHLH2Q02577 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
NHLH2Q02577 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
NHLH2Q02577 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
NHLH2Q02577 MARS-233ENST00000628866 2583 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
NHLH2Q02577 ADAM15-202ENST00000355956 2877 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
NHLH2Q02577 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
NHLH2Q02577 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
NHLH2Q02577 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
NHLH2Q02577 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
NHLH2Q02577 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
NHLH2Q02577 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
NHLH2Q02577 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
NHLH2Q02577 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
NHLH2Q02577 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
NHLH2Q02577 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
NHLH2Q02577 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
NHLH2Q02577 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
NHLH2Q02577 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
NHLH2Q02577 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
NHLH2Q02577 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
NHLH2Q02577 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
NHLH2Q02577 PPM1A-203ENST00000395076 8184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
NHLH2Q02577 FAM156A-206ENST00000612915 2233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
NHLH2Q02577 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
NHLH2Q02577 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
NHLH2Q02577 HSD17B4-206ENST00000504811 2740 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
NHLH2Q02577 CNTNAP3P2-201ENST00000617175 3861 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
NHLH2Q02577 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
NHLH2Q02577 CAPN7-201ENST00000253693 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
NHLH2Q02577 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
NHLH2Q02577 ATXN10-202ENST00000381061 3135 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
NHLH2Q02577 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
NHLH2Q02577 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
NHLH2Q02577 PHF19-203ENST00000419155 3525 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
NHLH2Q02577 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
NHLH2Q02577 RAB11FIP1-201ENST00000287263 6253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
NHLH2Q02577 SEC24D-202ENST00000419654 2786 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
NHLH2Q02577 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
NHLH2Q02577 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
NHLH2Q02577 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
NHLH2Q02577 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
NHLH2Q02577 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
NHLH2Q02577 HEMK1-201ENST00000232854 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
NHLH2Q02577 CCDC22-201ENST00000376227 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
NHLH2Q02577 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
NHLH2Q02577 TAF6-201ENST00000344095 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
NHLH2Q02577 ADAM15-203ENST00000356955 2949 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
NHLH2Q02577 SLC4A8-204ENST00000514353 3041 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
NHLH2Q02577 HNRNPDL-208ENST00000621267 4139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
NHLH2Q02577 GSG1L-203ENST00000447459 4916 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
NHLH2Q02577 ESRP2-202ENST00000473183 3793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
NHLH2Q02577 CLASP2-203ENST00000359576 7141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
NHLH2Q02577 STEAP2-202ENST00000394621 7033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
NHLH2Q02577 AGT-201ENST00000366667 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
NHLH2Q02577 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
NHLH2Q02577 AC232323.1-201ENST00000540724 2099 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
NHLH2Q02577 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
NHLH2Q02577 CUL7-203ENST00000535468 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
NHLH2Q02577 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
NHLH2Q02577 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
NHLH2Q02577 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
NHLH2Q02577 AC138028.2-202ENST00000567968 4528 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
NHLH2Q02577 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
NHLH2Q02577 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
NHLH2Q02577 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC13.13□□□□□ -0.31
NHLH2Q02577 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
NHLH2Q02577 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
NHLH2Q02577 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
NHLH2Q02577 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
NHLH2Q02577 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
NHLH2Q02577 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
NHLH2Q02577 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
NHLH2Q02577 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
NHLH2Q02577 SLC43A2-201ENST00000301335 8136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
NHLH2Q02577 SLC13A5-203ENST00000433363 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
NHLH2Q02577 MED16-203ENST00000325464 2922 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
NHLH2Q02577 ADAR-202ENST00000368474 6625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
NHLH2Q02577 MBD1-205ENST00000353909 2820 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
NHLH2Q02577 INO80-201ENST00000361937 6439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
NHLH2Q02577 TP53I11-208ENST00000525680 2647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
NHLH2Q02577 RGS3-201ENST00000317613 2542 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
NHLH2Q02577 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
NHLH2Q02577 RSPRY1-202ENST00000537866 3586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
NHLH2Q02577 IL9R-202ENST00000369423 2032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
NHLH2Q02577 UHRF1BP1-202ENST00000452449 4706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
NHLH2Q02577 ALDH1B1-201ENST00000377698 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
NHLH2Q02577 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
NHLH2Q02577 TSEN2-205ENST00000444864 2697 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
NHLH2Q02577 SAFB-202ENST00000454510 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
NHLH2Q02577 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
NHLH2Q02577 SPRED1-201ENST00000299084 7780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
NHLH2Q02577 TNS2-201ENST00000314250 5010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
NHLH2Q02577 AC112693.3-201ENST00000624819 1983 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
NHLH2Q02577 PSD-209ENST00000611678 3382 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
NHLH2Q02577 ATG4B-206ENST00000405546 3294 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.5 ms