Protein–RNA interactions for Protein: Q00975

CACNA1B, Voltage-dependent N-type calcium channel subunit alpha-1B, humanhuman

Predictions only

Length 2,339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1BQ00975 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CACNA1BQ00975 AL353770.1-201ENST00000614915 403 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
CACNA1BQ00975 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
CACNA1BQ00975 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
CACNA1BQ00975 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
CACNA1BQ00975 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
CACNA1BQ00975 GRAPL-201ENST00000344415 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
CACNA1BQ00975 OXNAD1-202ENST00000435829 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
CACNA1BQ00975 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
CACNA1BQ00975 FHL2-206ENST00000408995 1367 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
CACNA1BQ00975 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
CACNA1BQ00975 ANXA6-202ENST00000377751 1430 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
CACNA1BQ00975 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
CACNA1BQ00975 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
CACNA1BQ00975 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CACNA1BQ00975 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CACNA1BQ00975 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CACNA1BQ00975 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CACNA1BQ00975 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CACNA1BQ00975 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CACNA1BQ00975 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CACNA1BQ00975 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CACNA1BQ00975 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CACNA1BQ00975 GNG5-201ENST00000370641 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CACNA1BQ00975 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CACNA1BQ00975 FAM27E5-201ENST00000426869 682 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CACNA1BQ00975 VDAC1P7-201ENST00000462417 847 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
CACNA1BQ00975 RAP1B-216ENST00000537460 1072 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CACNA1BQ00975 AC125603.2-201ENST00000546835 876 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CACNA1BQ00975 AC242376.2-201ENST00000619355 883 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
CACNA1BQ00975 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CACNA1BQ00975 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CACNA1BQ00975 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CACNA1BQ00975 SLC25A3-217ENST00000552981 1351 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CACNA1BQ00975 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CACNA1BQ00975 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CACNA1BQ00975 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CACNA1BQ00975 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CACNA1BQ00975 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CACNA1BQ00975 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CACNA1BQ00975 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CACNA1BQ00975 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CACNA1BQ00975 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CACNA1BQ00975 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CACNA1BQ00975 RHOXF1-201ENST00000217999 769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CACNA1BQ00975 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CACNA1BQ00975 PPIE-202ENST00000356511 1079 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CACNA1BQ00975 PRSS30P-205ENST00000506153 699 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CACNA1BQ00975 AP000842.2-201ENST00000533033 517 ntTSL 4 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CACNA1BQ00975 AC013355.1-201ENST00000562625 723 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
CACNA1BQ00975 ANKRD11-208ENST00000563291 593 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CACNA1BQ00975 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CACNA1BQ00975 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CACNA1BQ00975 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CACNA1BQ00975 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CACNA1BQ00975 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CACNA1BQ00975 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CACNA1BQ00975 SLC51A-201ENST00000296327 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CACNA1BQ00975 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CACNA1BQ00975 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CACNA1BQ00975 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CACNA1BQ00975 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CACNA1BQ00975 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CACNA1BQ00975 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CACNA1BQ00975 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CACNA1BQ00975 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CACNA1BQ00975 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CACNA1BQ00975 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CACNA1BQ00975 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CACNA1BQ00975 IL23A-201ENST00000228534 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CACNA1BQ00975 SPACA3-201ENST00000269053 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CACNA1BQ00975 C18orf21-202ENST00000333234 958 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CACNA1BQ00975 CIDEC-201ENST00000336832 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CACNA1BQ00975 SMS-201ENST00000379404 1174 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CACNA1BQ00975 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
CACNA1BQ00975 AL157392.1-201ENST00000412388 373 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CACNA1BQ00975 CIDEC-203ENST00000423850 1036 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CACNA1BQ00975 CIDEC-206ENST00000455015 1123 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CACNA1BQ00975 SPACA3-205ENST00000580599 949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CACNA1BQ00975 KLK11-210ENST00000600362 759 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CACNA1BQ00975 AC244250.3-201ENST00000620749 366 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
CACNA1BQ00975 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CACNA1BQ00975 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CACNA1BQ00975 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CACNA1BQ00975 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CACNA1BQ00975 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CACNA1BQ00975 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CACNA1BQ00975 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CACNA1BQ00975 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CACNA1BQ00975 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CACNA1BQ00975 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
CACNA1BQ00975 ARF5-201ENST00000000233 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CACNA1BQ00975 COX8A-201ENST00000314133 507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CACNA1BQ00975 AC006335.1-201ENST00000445200 547 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
CACNA1BQ00975 AL645728.2-202ENST00000641679 227 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
CACNA1BQ00975 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CACNA1BQ00975 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CACNA1BQ00975 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CACNA1BQ00975 MRPL11-201ENST00000310999 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CACNA1BQ00975 NOS2P2-202ENST00000639528 1659 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms