Protein–RNA interactions for Protein: P82094

TMF1, TATA element modulatory factor, humanhuman

Predictions only

Length 1,093 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMF1P82094 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TMF1P82094 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TMF1P82094 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TMF1P82094 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TMF1P82094 AC004233.3-201ENST00000607794 1269 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
TMF1P82094 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TMF1P82094 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TMF1P82094 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TMF1P82094 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TMF1P82094 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TMF1P82094 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TMF1P82094 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TMF1P82094 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TMF1P82094 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TMF1P82094 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TMF1P82094 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TMF1P82094 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TMF1P82094 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TMF1P82094 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TMF1P82094 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TMF1P82094 FAM159B-201ENST00000389074 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TMF1P82094 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TMF1P82094 PIN1P1-201ENST00000412108 996 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
TMF1P82094 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TMF1P82094 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TMF1P82094 DOC2GP-202ENST00000514950 1163 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
TMF1P82094 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TMF1P82094 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
TMF1P82094 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TMF1P82094 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TMF1P82094 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TMF1P82094 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TMF1P82094 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TMF1P82094 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TMF1P82094 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TMF1P82094 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TMF1P82094 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TMF1P82094 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TMF1P82094 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
TMF1P82094 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TMF1P82094 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TMF1P82094 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TMF1P82094 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TMF1P82094 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TMF1P82094 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TMF1P82094 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TMF1P82094 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TMF1P82094 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TMF1P82094 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TMF1P82094 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TMF1P82094 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TMF1P82094 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TMF1P82094 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TMF1P82094 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TMF1P82094 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TMF1P82094 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TMF1P82094 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TMF1P82094 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TMF1P82094 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TMF1P82094 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TMF1P82094 GNAQP1-201ENST00000444815 1067 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
TMF1P82094 AL589987.1-201ENST00000453380 819 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
TMF1P82094 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
TMF1P82094 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
TMF1P82094 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TMF1P82094 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TMF1P82094 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TMF1P82094 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TMF1P82094 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TMF1P82094 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TMF1P82094 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TMF1P82094 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TMF1P82094 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TMF1P82094 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TMF1P82094 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TMF1P82094 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TMF1P82094 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TMF1P82094 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TMF1P82094 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TMF1P82094 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TMF1P82094 ZSCAN2-203ENST00000334141 993 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TMF1P82094 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
TMF1P82094 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TMF1P82094 SNCA-205ENST00000394991 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TMF1P82094 PNKD-204ENST00000436005 978 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TMF1P82094 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
TMF1P82094 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TMF1P82094 CHMP4A-204ENST00000530996 967 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TMF1P82094 TUBB3-203ENST00000553967 736 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TMF1P82094 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TMF1P82094 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TMF1P82094 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TMF1P82094 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TMF1P82094 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
TMF1P82094 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TMF1P82094 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TMF1P82094 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TMF1P82094 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TMF1P82094 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TMF1P82094 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.9 ms