Protein–RNA interactions for Protein: P51531

SMARCA2, Probable global transcription activator SNF2L2, humanhuman

Predictions only

Length 1,590 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCA2P51531 AC016825.1-201ENST00000433600 778 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
SMARCA2P51531 ATP6V0CP2-201ENST00000469409 207 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
SMARCA2P51531 AC007663.3-201ENST00000609632 465 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
SMARCA2P51531 ZCCHC17-207ENST00000616859 1458 ntTSL 4 BASIC27.92■■■□□ 2.06
SMARCA2P51531 ZCCHC17-208ENST00000618216 1489 ntTSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
SMARCA2P51531 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
SMARCA2P51531 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
SMARCA2P51531 USE1-202ENST00000445667 795 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
SMARCA2P51531 ATP6V1G2-210ENST00000483251 662 ntTSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
SMARCA2P51531 AL355310.3-201ENST00000526411 582 ntTSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
SMARCA2P51531 RNF41-210ENST00000552244 716 ntTSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
SMARCA2P51531 AC105105.3-201ENST00000585470 646 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
SMARCA2P51531 LINC01669-205ENST00000624561 713 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
SMARCA2P51531 LINC02273-201ENST00000499452 1592 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
SMARCA2P51531 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
SMARCA2P51531 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
SMARCA2P51531 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
SMARCA2P51531 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
SMARCA2P51531 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
SMARCA2P51531 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
SMARCA2P51531 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
SMARCA2P51531 NDUFB8-201ENST00000299166 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
SMARCA2P51531 NDUFAB1P1-201ENST00000404262 460 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
SMARCA2P51531 AL354877.1-201ENST00000424412 413 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
SMARCA2P51531 LINC01006-204ENST00000435354 545 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
SMARCA2P51531 ARMCX3-AS1-201ENST00000454228 490 ntTSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
SMARCA2P51531 BX322559.1-201ENST00000456613 319 ntTSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
SMARCA2P51531 PRPS2-205ENST00000489404 763 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
SMARCA2P51531 ZNF419-208ENST00000518999 746 ntTSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
SMARCA2P51531 AC134698.3-201ENST00000523880 214 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
SMARCA2P51531 RCE1-204ENST00000525356 1270 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
SMARCA2P51531 MIR3907-201ENST00000579424 151 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
SMARCA2P51531 AP003419.4-201ENST00000616071 517 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
SMARCA2P51531 GPR39-203ENST00000622084 900 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
SMARCA2P51531 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
SMARCA2P51531 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
SMARCA2P51531 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
SMARCA2P51531 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
SMARCA2P51531 CPA5-201ENST00000393213 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
SMARCA2P51531 CES4A-203ENST00000535696 1472 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
SMARCA2P51531 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
SMARCA2P51531 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
SMARCA2P51531 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
SMARCA2P51531 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
SMARCA2P51531 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
SMARCA2P51531 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
SMARCA2P51531 ATP6V1F-201ENST00000249289 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
SMARCA2P51531 THOC6-201ENST00000253952 1246 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
SMARCA2P51531 CLRN1-203ENST00000328863 738 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
SMARCA2P51531 SF3B5-201ENST00000367569 693 ntAPPRIS P1 BASIC27.9■■■□□ 2.06
SMARCA2P51531 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
SMARCA2P51531 AL139246.4-201ENST00000442305 514 ntTSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
SMARCA2P51531 RPL35A-205ENST00000448864 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
SMARCA2P51531 COX5BP1-201ENST00000507622 393 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
SMARCA2P51531 AL136088.1-202ENST00000525871 439 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
SMARCA2P51531 PRKXP1-201ENST00000561423 1122 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
SMARCA2P51531 FAAP24-204ENST00000590179 784 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
SMARCA2P51531 AC073413.1-201ENST00000603927 732 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
SMARCA2P51531 AC008132.1-202ENST00000342005 1389 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
SMARCA2P51531 CHAT-212ENST00000640822 1412 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
SMARCA2P51531 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
SMARCA2P51531 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
SMARCA2P51531 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
SMARCA2P51531 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
SMARCA2P51531 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
SMARCA2P51531 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
SMARCA2P51531 CMA1-202ENST00000250378 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
SMARCA2P51531 C1orf43-205ENST00000368519 1163 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.05
SMARCA2P51531 AC079807.2-203ENST00000417692 656 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.05
SMARCA2P51531 AL162457.2-202ENST00000442888 679 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.05
SMARCA2P51531 AC008267.1-201ENST00000474858 1069 ntBASIC27.89■■■□□ 2.05
SMARCA2P51531 CFL1-214ENST00000534769 758 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.05
SMARCA2P51531 ZNF385A-213ENST00000551771 1111 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
SMARCA2P51531 AC016044.1-201ENST00000560818 572 ntTSL 4 BASIC27.89■■■□□ 2.05
SMARCA2P51531 AC244157.2-201ENST00000616239 1006 ntBASIC27.89■■■□□ 2.05
SMARCA2P51531 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.05
SMARCA2P51531 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
SMARCA2P51531 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
SMARCA2P51531 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
SMARCA2P51531 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
SMARCA2P51531 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
SMARCA2P51531 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
SMARCA2P51531 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
SMARCA2P51531 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
SMARCA2P51531 AKIP1-201ENST00000299576 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
SMARCA2P51531 KRTAP21-2-201ENST00000333892 440 ntAPPRIS P1 BASIC27.88■■■□□ 2.05
SMARCA2P51531 PENK-202ENST00000451791 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
SMARCA2P51531 RN7SL11P-201ENST00000471305 293 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
SMARCA2P51531 SUPT4H1P2-201ENST00000501248 353 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
SMARCA2P51531 AC025154.1-201ENST00000552806 560 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
SMARCA2P51531 TCL1A-208ENST00000556450 872 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
SMARCA2P51531 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
SMARCA2P51531 BCAS4-201ENST00000358791 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
SMARCA2P51531 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
SMARCA2P51531 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
SMARCA2P51531 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
SMARCA2P51531 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
SMARCA2P51531 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
SMARCA2P51531 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
SMARCA2P51531 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms