Protein–RNA interactions for Protein: P48506

GCLC, Glutamate--cysteine ligase catalytic subunit, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 637 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCLCP48506 AP000552.1-208ENST00000452952 576 ntTSL 4 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GCLCP48506 STAG3L5P-205ENST00000473757 1255 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GCLCP48506 AC106786.2-201ENST00000506859 561 ntTSL 4 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GCLCP48506 SPDYE16-201ENST00000515340 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GCLCP48506 CEP57L1-208ENST00000519095 908 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GCLCP48506 ZNF7-206ENST00000528130 1134 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GCLCP48506 GNAL-204ENST00000535121 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GCLCP48506 AGER-214ENST00000538695 487 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GCLCP48506 AC079316.1-201ENST00000548397 411 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
GCLCP48506 AC120045.2-201ENST00000567334 178 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
GCLCP48506 SHBG-212ENST00000575314 1146 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GCLCP48506 RPL36-203ENST00000577222 874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GCLCP48506 RAB11B-202ENST00000594216 894 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GCLCP48506 LINC02351-201ENST00000614728 289 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GCLCP48506 AGER-215ENST00000620802 737 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GCLCP48506 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GCLCP48506 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GCLCP48506 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GCLCP48506 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GCLCP48506 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GCLCP48506 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GCLCP48506 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GCLCP48506 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GCLCP48506 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GCLCP48506 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GCLCP48506 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GCLCP48506 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GCLCP48506 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GCLCP48506 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GCLCP48506 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GCLCP48506 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GCLCP48506 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GCLCP48506 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GCLCP48506 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GCLCP48506 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GCLCP48506 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GCLCP48506 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GCLCP48506 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GCLCP48506 FDFT1-202ENST00000443614 1393 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GCLCP48506 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GCLCP48506 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GCLCP48506 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GCLCP48506 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GCLCP48506 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GCLCP48506 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GCLCP48506 GAS2L3-201ENST00000266754 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GCLCP48506 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GCLCP48506 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GCLCP48506 ITIH1-202ENST00000405128 1122 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GCLCP48506 AC096536.1-201ENST00000443284 440 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GCLCP48506 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GCLCP48506 AC072022.1-201ENST00000450760 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GCLCP48506 POLR2F-208ENST00000470701 584 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GCLCP48506 AC106886.2-201ENST00000483578 883 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GCLCP48506 TIMM8B-201ENST00000504148 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GCLCP48506 AP001360.1-202ENST00000526934 479 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GCLCP48506 TAPBPL-205ENST00000544021 772 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GCLCP48506 AC010491.1-202ENST00000567048 528 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GCLCP48506 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GCLCP48506 AC103810.3-201ENST00000583567 96 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
GCLCP48506 COX6B1-204ENST00000592141 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GCLCP48506 AL354740.1-203ENST00000593917 424 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GCLCP48506 ANXA2R-202ENST00000616064 1265 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GCLCP48506 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GCLCP48506 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GCLCP48506 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GCLCP48506 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GCLCP48506 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GCLCP48506 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GCLCP48506 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GCLCP48506 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GCLCP48506 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GCLCP48506 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GCLCP48506 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GCLCP48506 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GCLCP48506 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GCLCP48506 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GCLCP48506 FAM169B-201ENST00000332908 579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GCLCP48506 TSPAN32-204ENST00000381121 999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GCLCP48506 C1QBPP1-201ENST00000400117 770 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
GCLCP48506 BAATP1-201ENST00000412284 1225 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
GCLCP48506 TAF8-204ENST00000456846 1293 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GCLCP48506 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GCLCP48506 LINC01089-209ENST00000542933 1220 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GCLCP48506 C12orf57-206ENST00000544681 980 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GCLCP48506 AL118558.1-202ENST00000557242 451 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GCLCP48506 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GCLCP48506 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GCLCP48506 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GCLCP48506 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GCLCP48506 PRG2-202ENST00000525955 1367 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GCLCP48506 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GCLCP48506 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GCLCP48506 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
GCLCP48506 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
GCLCP48506 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
GCLCP48506 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
GCLCP48506 ACP2-205ENST00000527256 1499 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
GCLCP48506 ODF3-201ENST00000325113 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
GCLCP48506 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.3 ms