Protein–RNA interactions for Protein: P48165

GJA8, Gap junction alpha-8 protein, humanhuman

Predictions only

Length 433 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJA8P48165 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
GJA8P48165 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GJA8P48165 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GJA8P48165 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
GJA8P48165 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
GJA8P48165 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GJA8P48165 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GJA8P48165 KLK6-203ENST00000391808 1478 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GJA8P48165 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
GJA8P48165 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GJA8P48165 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
GJA8P48165 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
GJA8P48165 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GJA8P48165 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GJA8P48165 AC018735.1-201ENST00000437208 1502 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
GJA8P48165 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GJA8P48165 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
GJA8P48165 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GJA8P48165 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GJA8P48165 FAM83A-201ENST00000276699 1858 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GJA8P48165 SLURP2-201ENST00000317543 599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GJA8P48165 UBE3B-201ENST00000340074 1448 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GJA8P48165 CABP1-203ENST00000351200 770 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GJA8P48165 GNG5-201ENST00000370641 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GJA8P48165 CSNK2B-201ENST00000375865 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
GJA8P48165 MPV17-204ENST00000399052 749 ntTSL 4 BASIC17.68■□□□□ 0.42
GJA8P48165 CD8A-204ENST00000409781 597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
GJA8P48165 AL121601.1-201ENST00000426367 326 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
GJA8P48165 DUSP13-206ENST00000472493 920 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GJA8P48165 RN7SL720P-201ENST00000488178 304 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
GJA8P48165 LEF1-AS1-204ENST00000508266 559 ntTSL 4 BASIC17.68■□□□□ 0.42
GJA8P48165 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
GJA8P48165 IL32-222ENST00000533097 814 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
GJA8P48165 LRRC37A6P-204ENST00000575554 573 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
GJA8P48165 IFT20-206ENST00000578122 834 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
GJA8P48165 IFT20-208ENST00000578985 831 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
GJA8P48165 GEMIN7-204ENST00000591747 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
GJA8P48165 AL451050.2-201ENST00000606967 682 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
GJA8P48165 AC132938.4-201ENST00000623835 848 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
GJA8P48165 CU633904.3-201ENST00000624042 1029 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
GJA8P48165 AL137026.1-201ENST00000624407 503 ntTSL 4 BASIC17.68■□□□□ 0.42
GJA8P48165 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
GJA8P48165 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
GJA8P48165 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
GJA8P48165 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
GJA8P48165 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
GJA8P48165 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
GJA8P48165 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GJA8P48165 RTN4IP1-201ENST00000369063 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
GJA8P48165 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
GJA8P48165 PSMC3-209ENST00000530912 1390 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
GJA8P48165 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
GJA8P48165 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
GJA8P48165 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
GJA8P48165 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
GJA8P48165 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
GJA8P48165 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
GJA8P48165 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
GJA8P48165 ATP6V1C2-201ENST00000272238 1565 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
GJA8P48165 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
GJA8P48165 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
GJA8P48165 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
GJA8P48165 CBY1-201ENST00000216029 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
GJA8P48165 MRPL34-201ENST00000252602 968 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
GJA8P48165 AL445430.1-201ENST00000419796 699 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
GJA8P48165 ARMCX3-AS1-201ENST00000454228 490 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
GJA8P48165 FHIT-208ENST00000492590 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
GJA8P48165 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
GJA8P48165 TSPO-206ENST00000583777 636 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
GJA8P48165 CYGB-203ENST00000589145 788 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
GJA8P48165 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
GJA8P48165 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
GJA8P48165 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
GJA8P48165 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
GJA8P48165 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
GJA8P48165 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
GJA8P48165 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
GJA8P48165 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
GJA8P48165 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
GJA8P48165 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC17.67■□□□□ 0.42
GJA8P48165 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
GJA8P48165 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
GJA8P48165 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
GJA8P48165 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
GJA8P48165 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
GJA8P48165 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
GJA8P48165 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
GJA8P48165 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
GJA8P48165 TMEM254-204ENST00000372277 366 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
GJA8P48165 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
GJA8P48165 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
GJA8P48165 MB-205ENST00000406324 582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
GJA8P48165 TMEM177-203ENST00000409951 1216 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
GJA8P48165 LINC01762-204ENST00000434879 436 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
GJA8P48165 POM121L10P-201ENST00000436994 1285 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
GJA8P48165 FTLP1-201ENST00000449155 526 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
GJA8P48165 AC126915.1-201ENST00000522847 1038 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
GJA8P48165 EIF3M-203ENST00000524896 1207 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
GJA8P48165 AC020763.1-201ENST00000567186 551 ntTSL 4 BASIC17.66■□□□□ 0.42
GJA8P48165 TMEM205-216ENST00000593256 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.5 ms