Protein–RNA interactions for Protein: P42338

PIK3CB, Phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate 3-kinase catalytic subunit beta isoform, humanhuman

Predictions only

Length 1,070 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIK3CBP42338 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PIK3CBP42338 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PIK3CBP42338 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PIK3CBP42338 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PIK3CBP42338 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PIK3CBP42338 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PIK3CBP42338 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PIK3CBP42338 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PIK3CBP42338 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PIK3CBP42338 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PIK3CBP42338 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PIK3CBP42338 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PIK3CBP42338 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
PIK3CBP42338 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PIK3CBP42338 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PIK3CBP42338 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PIK3CBP42338 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PIK3CBP42338 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PIK3CBP42338 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PIK3CBP42338 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PIK3CBP42338 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PIK3CBP42338 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PIK3CBP42338 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PIK3CBP42338 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PIK3CBP42338 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PIK3CBP42338 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PIK3CBP42338 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PIK3CBP42338 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PIK3CBP42338 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PIK3CBP42338 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PIK3CBP42338 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PIK3CBP42338 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PIK3CBP42338 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PIK3CBP42338 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PIK3CBP42338 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PIK3CBP42338 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PIK3CBP42338 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PIK3CBP42338 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PIK3CBP42338 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PIK3CBP42338 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PIK3CBP42338 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PIK3CBP42338 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PIK3CBP42338 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PIK3CBP42338 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PIK3CBP42338 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PIK3CBP42338 HNRNPA0-201ENST00000314940 8726 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PIK3CBP42338 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PIK3CBP42338 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PIK3CBP42338 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PIK3CBP42338 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PIK3CBP42338 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PIK3CBP42338 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PIK3CBP42338 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PIK3CBP42338 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PIK3CBP42338 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PIK3CBP42338 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PIK3CBP42338 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PIK3CBP42338 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PIK3CBP42338 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PIK3CBP42338 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PIK3CBP42338 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
PIK3CBP42338 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PIK3CBP42338 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
PIK3CBP42338 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
PIK3CBP42338 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PIK3CBP42338 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PIK3CBP42338 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PIK3CBP42338 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PIK3CBP42338 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PIK3CBP42338 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PIK3CBP42338 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
PIK3CBP42338 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PIK3CBP42338 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PIK3CBP42338 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
PIK3CBP42338 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PIK3CBP42338 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PIK3CBP42338 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PIK3CBP42338 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PIK3CBP42338 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PIK3CBP42338 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PIK3CBP42338 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PIK3CBP42338 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PIK3CBP42338 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PIK3CBP42338 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PIK3CBP42338 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PIK3CBP42338 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
PIK3CBP42338 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PIK3CBP42338 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PIK3CBP42338 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PIK3CBP42338 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PIK3CBP42338 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PIK3CBP42338 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PIK3CBP42338 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PIK3CBP42338 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PIK3CBP42338 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PIK3CBP42338 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
PIK3CBP42338 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PIK3CBP42338 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PIK3CBP42338 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PIK3CBP42338 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.8 ms