Protein–RNA interactions for Protein: P35453

HOXD13, Homeobox protein Hox-D13, humanhuman

Predictions only

Length 343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD13P35453 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
HOXD13P35453 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
HOXD13P35453 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
HOXD13P35453 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
HOXD13P35453 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
HOXD13P35453 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
HOXD13P35453 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
HOXD13P35453 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
HOXD13P35453 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
HOXD13P35453 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
HOXD13P35453 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
HOXD13P35453 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
HOXD13P35453 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
HOXD13P35453 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
HOXD13P35453 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
HOXD13P35453 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
HOXD13P35453 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
HOXD13P35453 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
HOXD13P35453 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC17.49■□□□□ 0.39
HOXD13P35453 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
HOXD13P35453 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
HOXD13P35453 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
HOXD13P35453 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
HOXD13P35453 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
HOXD13P35453 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
HOXD13P35453 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
HOXD13P35453 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
HOXD13P35453 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
HOXD13P35453 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
HOXD13P35453 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
HOXD13P35453 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
HOXD13P35453 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
HOXD13P35453 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
HOXD13P35453 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
HOXD13P35453 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
HOXD13P35453 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
HOXD13P35453 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
HOXD13P35453 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
HOXD13P35453 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
HOXD13P35453 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
HOXD13P35453 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
HOXD13P35453 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
HOXD13P35453 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
HOXD13P35453 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
HOXD13P35453 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
HOXD13P35453 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
HOXD13P35453 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
HOXD13P35453 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
HOXD13P35453 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
HOXD13P35453 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
HOXD13P35453 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
HOXD13P35453 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
HOXD13P35453 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
HOXD13P35453 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
HOXD13P35453 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
HOXD13P35453 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
HOXD13P35453 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
HOXD13P35453 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
HOXD13P35453 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
HOXD13P35453 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC17.48■□□□□ 0.39
HOXD13P35453 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
HOXD13P35453 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
HOXD13P35453 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
HOXD13P35453 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
HOXD13P35453 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
HOXD13P35453 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
HOXD13P35453 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
HOXD13P35453 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
HOXD13P35453 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
HOXD13P35453 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
HOXD13P35453 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
HOXD13P35453 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
HOXD13P35453 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
HOXD13P35453 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
HOXD13P35453 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
HOXD13P35453 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
HOXD13P35453 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
HOXD13P35453 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
HOXD13P35453 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
HOXD13P35453 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
HOXD13P35453 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
HOXD13P35453 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
HOXD13P35453 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
HOXD13P35453 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
HOXD13P35453 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
HOXD13P35453 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
HOXD13P35453 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
HOXD13P35453 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
HOXD13P35453 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
HOXD13P35453 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
HOXD13P35453 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
HOXD13P35453 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
HOXD13P35453 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
HOXD13P35453 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
HOXD13P35453 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
HOXD13P35453 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
HOXD13P35453 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
HOXD13P35453 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
HOXD13P35453 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
HOXD13P35453 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45 ms