Protein–RNA interactions for Protein: P26006

ITGA3, Integrin alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,051 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA3P26006 SPATA8-AS1-201ENST00000558722 465 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
ITGA3P26006 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
ITGA3P26006 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
ITGA3P26006 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ITGA3P26006 VCX-203ENST00000620630 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
ITGA3P26006 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ITGA3P26006 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ITGA3P26006 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
ITGA3P26006 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ITGA3P26006 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
ITGA3P26006 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
ITGA3P26006 PTPN9-206ENST00000618819 7813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ITGA3P26006 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ITGA3P26006 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ITGA3P26006 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC15.06■□□□□ 0
ITGA3P26006 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ITGA3P26006 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ITGA3P26006 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ITGA3P26006 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
ITGA3P26006 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC15.06■□□□□ 0
ITGA3P26006 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
ITGA3P26006 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
ITGA3P26006 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
ITGA3P26006 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
ITGA3P26006 LMX1B-201ENST00000355497 5809 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
ITGA3P26006 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
ITGA3P26006 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
ITGA3P26006 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
ITGA3P26006 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
ITGA3P26006 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
ITGA3P26006 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
ITGA3P26006 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
ITGA3P26006 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
ITGA3P26006 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
ITGA3P26006 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
ITGA3P26006 RREB1-202ENST00000349384 7440 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ITGA3P26006 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ITGA3P26006 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ITGA3P26006 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
ITGA3P26006 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ITGA3P26006 BLCAP-202ENST00000397131 633 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
ITGA3P26006 BLCAP-203ENST00000397134 566 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
ITGA3P26006 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ITGA3P26006 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ITGA3P26006 LEPROTL1-202ENST00000442880 908 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
ITGA3P26006 SLC25A30-AS1-201ENST00000506633 701 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
ITGA3P26006 FAM212B-207ENST00000534365 1217 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
ITGA3P26006 AL596325.1-201ENST00000563991 1082 ntBASIC15.05■□□□□ -0
ITGA3P26006 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
ITGA3P26006 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
ITGA3P26006 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC15.05■□□□□ -0
ITGA3P26006 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ITGA3P26006 SNHG28-203ENST00000621242 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
ITGA3P26006 BCRP3-202ENST00000621462 1021 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
ITGA3P26006 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC15.05■□□□□ -0
ITGA3P26006 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
ITGA3P26006 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ITGA3P26006 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
ITGA3P26006 AL353997.2-201ENST00000579352 4955 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ITGA3P26006 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ITGA3P26006 DIS3-202ENST00000377780 5232 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ITGA3P26006 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
ITGA3P26006 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ITGA3P26006 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
ITGA3P26006 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
ITGA3P26006 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ITGA3P26006 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ITGA3P26006 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ITGA3P26006 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
ITGA3P26006 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
ITGA3P26006 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
ITGA3P26006 UBR5-201ENST00000220959 9418 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ITGA3P26006 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
ITGA3P26006 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC15.04■□□□□ -0
ITGA3P26006 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ITGA3P26006 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ITGA3P26006 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ITGA3P26006 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ITGA3P26006 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ITGA3P26006 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ITGA3P26006 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ITGA3P26006 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ITGA3P26006 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC15.04■□□□□ -0
ITGA3P26006 RCOR1-201ENST00000262241 5754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ITGA3P26006 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
ITGA3P26006 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ITGA3P26006 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ITGA3P26006 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
ITGA3P26006 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ITGA3P26006 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ITGA3P26006 RUNX1T1-246ENST00000523629 7537 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
ITGA3P26006 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
ITGA3P26006 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
ITGA3P26006 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ITGA3P26006 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
ITGA3P26006 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ITGA3P26006 CUTA-202ENST00000374496 762 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
ITGA3P26006 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ITGA3P26006 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ITGA3P26006 FYCO1-203ENST00000438446 1072 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.9 ms