Protein–RNA interactions for Protein: P22415

USF1, Upstream stimulatory factor 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 310 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USF1P22415 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
USF1P22415 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
USF1P22415 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
USF1P22415 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
USF1P22415 MICAL3-206ENST00000441493 9445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
USF1P22415 NUTM2D-202ENST00000412718 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
USF1P22415 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
USF1P22415 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
USF1P22415 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
USF1P22415 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
USF1P22415 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
USF1P22415 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
USF1P22415 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
USF1P22415 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
USF1P22415 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
USF1P22415 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
USF1P22415 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
USF1P22415 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
USF1P22415 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
USF1P22415 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
USF1P22415 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
USF1P22415 THOC7-201ENST00000295899 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
USF1P22415 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC13.69□□□□□ -0.22
USF1P22415 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC13.69□□□□□ -0.22
USF1P22415 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
USF1P22415 ADIRF-201ENST00000372013 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
USF1P22415 C9orf24-204ENST00000379127 596 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
USF1P22415 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
USF1P22415 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
USF1P22415 KRTAP6-3-201ENST00000391624 636 ntAPPRIS P1 BASIC13.69□□□□□ -0.22
USF1P22415 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
USF1P22415 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
USF1P22415 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
USF1P22415 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
USF1P22415 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
USF1P22415 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
USF1P22415 SLC25A30-AS1-201ENST00000506633 701 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
USF1P22415 CDK4-206ENST00000549606 558 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
USF1P22415 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
USF1P22415 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC13.69□□□□□ -0.22
USF1P22415 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
USF1P22415 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
USF1P22415 FAM66A-202ENST00000602658 546 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
USF1P22415 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
USF1P22415 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
USF1P22415 DNAJC5-201ENST00000360864 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
USF1P22415 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
USF1P22415 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
USF1P22415 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
USF1P22415 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
USF1P22415 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
USF1P22415 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
USF1P22415 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
USF1P22415 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
USF1P22415 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
USF1P22415 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
USF1P22415 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
USF1P22415 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
USF1P22415 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
USF1P22415 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
USF1P22415 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
USF1P22415 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
USF1P22415 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
USF1P22415 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
USF1P22415 CAMKK2-201ENST00000324774 5598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
USF1P22415 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
USF1P22415 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
USF1P22415 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
USF1P22415 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
USF1P22415 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
USF1P22415 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
USF1P22415 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
USF1P22415 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
USF1P22415 DSEL-201ENST00000310045 9531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
USF1P22415 DYSF-201ENST00000258104 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
USF1P22415 DYSF-204ENST00000409582 6790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
USF1P22415 DYSF-210ENST00000413539 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
USF1P22415 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
USF1P22415 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
USF1P22415 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
USF1P22415 CU639417.3-201ENST00000624240 1404 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
USF1P22415 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
USF1P22415 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
USF1P22415 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
USF1P22415 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
USF1P22415 OR8S1-201ENST00000310194 1080 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
USF1P22415 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC13.68□□□□□ -0.22
USF1P22415 NDUFB8-202ENST00000370320 684 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
USF1P22415 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
USF1P22415 WDR45-208ENST00000396681 1146 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
USF1P22415 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
USF1P22415 COX5BP8-201ENST00000416911 349 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
USF1P22415 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
USF1P22415 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
USF1P22415 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
USF1P22415 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
USF1P22415 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
USF1P22415 IFI27-210ENST00000616764 716 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
USF1P22415 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
USF1P22415 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
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