Protein–RNA interactions for Protein: P20827

EFNA1, Ephrin-A1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFNA1P20827 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
EFNA1P20827 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
EFNA1P20827 AC012313.3-202ENST00000599109 3322 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
EFNA1P20827 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
EFNA1P20827 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
EFNA1P20827 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
EFNA1P20827 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
EFNA1P20827 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
EFNA1P20827 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
EFNA1P20827 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
EFNA1P20827 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
EFNA1P20827 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
EFNA1P20827 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
EFNA1P20827 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
EFNA1P20827 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
EFNA1P20827 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
EFNA1P20827 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
EFNA1P20827 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
EFNA1P20827 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
EFNA1P20827 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
EFNA1P20827 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
EFNA1P20827 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
EFNA1P20827 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
EFNA1P20827 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
EFNA1P20827 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
EFNA1P20827 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
EFNA1P20827 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
EFNA1P20827 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
EFNA1P20827 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
EFNA1P20827 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
EFNA1P20827 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
EFNA1P20827 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
EFNA1P20827 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
EFNA1P20827 HGNC:18790-202ENST00000421177 4172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
EFNA1P20827 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
EFNA1P20827 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
EFNA1P20827 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
EFNA1P20827 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
EFNA1P20827 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
EFNA1P20827 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
EFNA1P20827 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
EFNA1P20827 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
EFNA1P20827 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
EFNA1P20827 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
EFNA1P20827 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
EFNA1P20827 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
EFNA1P20827 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
EFNA1P20827 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
EFNA1P20827 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
EFNA1P20827 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
EFNA1P20827 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
EFNA1P20827 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
EFNA1P20827 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
EFNA1P20827 KCNMA1-219ENST00000480683 2963 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
EFNA1P20827 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
EFNA1P20827 TAOK3-201ENST00000392533 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
EFNA1P20827 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
EFNA1P20827 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
EFNA1P20827 WASHC2C-208ENST00000537517 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
EFNA1P20827 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
EFNA1P20827 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
EFNA1P20827 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
EFNA1P20827 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
EFNA1P20827 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
EFNA1P20827 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
EFNA1P20827 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
EFNA1P20827 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
EFNA1P20827 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
EFNA1P20827 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
EFNA1P20827 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
EFNA1P20827 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
EFNA1P20827 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
EFNA1P20827 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
EFNA1P20827 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
EFNA1P20827 ZFPM2-201ENST00000407775 4700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
EFNA1P20827 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
EFNA1P20827 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
EFNA1P20827 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
EFNA1P20827 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
EFNA1P20827 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
EFNA1P20827 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
EFNA1P20827 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
EFNA1P20827 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
EFNA1P20827 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
EFNA1P20827 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
EFNA1P20827 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
EFNA1P20827 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
EFNA1P20827 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
EFNA1P20827 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
EFNA1P20827 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
EFNA1P20827 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
EFNA1P20827 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
EFNA1P20827 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
EFNA1P20827 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
EFNA1P20827 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
EFNA1P20827 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
EFNA1P20827 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
EFNA1P20827 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
EFNA1P20827 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
EFNA1P20827 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms