Protein–RNA interactions for Protein: P20132

SDS, L-serine dehydratase/L-threonine deaminase, humanhuman

Predictions only

Length 328 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDSP20132 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SDSP20132 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SDSP20132 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SDSP20132 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SDSP20132 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
SDSP20132 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SDSP20132 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SDSP20132 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SDSP20132 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SDSP20132 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SDSP20132 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
SDSP20132 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SDSP20132 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SDSP20132 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SDSP20132 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SDSP20132 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SDSP20132 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SDSP20132 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SDSP20132 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SDSP20132 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SDSP20132 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SDSP20132 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SDSP20132 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC19.58■□□□□ 0.73
SDSP20132 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
SDSP20132 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC19.58■□□□□ 0.73
SDSP20132 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
SDSP20132 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
SDSP20132 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
SDSP20132 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
SDSP20132 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
SDSP20132 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
SDSP20132 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
SDSP20132 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
SDSP20132 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
SDSP20132 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
SDSP20132 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
SDSP20132 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
SDSP20132 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SDSP20132 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SDSP20132 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
SDSP20132 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
SDSP20132 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
SDSP20132 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
SDSP20132 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
SDSP20132 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SDSP20132 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
SDSP20132 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
SDSP20132 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
SDSP20132 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
SDSP20132 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
SDSP20132 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
SDSP20132 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
SDSP20132 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
SDSP20132 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
SDSP20132 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SDSP20132 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SDSP20132 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
SDSP20132 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
SDSP20132 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SDSP20132 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SDSP20132 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SDSP20132 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SDSP20132 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SDSP20132 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SDSP20132 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SDSP20132 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SDSP20132 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SDSP20132 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SDSP20132 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SDSP20132 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SDSP20132 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SDSP20132 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SDSP20132 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SDSP20132 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
SDSP20132 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SDSP20132 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
SDSP20132 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SDSP20132 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SDSP20132 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SDSP20132 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SDSP20132 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SDSP20132 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SDSP20132 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SDSP20132 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SDSP20132 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
SDSP20132 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SDSP20132 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SDSP20132 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SDSP20132 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SDSP20132 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
SDSP20132 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SDSP20132 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SDSP20132 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SDSP20132 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SDSP20132 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SDSP20132 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SDSP20132 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SDSP20132 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SDSP20132 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SDSP20132 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
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