Protein–RNA interactions for Protein: P19876

CXCL3, C-X-C motif chemokine 3, humanhuman

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Length 107 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL3P19876 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CXCL3P19876 INF2-209ENST00000617571 2956 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CXCL3P19876 ANKRD13B-201ENST00000394859 3214 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CXCL3P19876 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CXCL3P19876 RNPS1-216ENST00000565678 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CXCL3P19876 CD8A-203ENST00000409511 3048 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CXCL3P19876 USP36-201ENST00000312010 5234 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CXCL3P19876 TPRX1-202ENST00000535759 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CXCL3P19876 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CXCL3P19876 DEPTOR-201ENST00000286234 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CXCL3P19876 DFNA5-201ENST00000342947 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CXCL3P19876 FAM120A-202ENST00000375389 3585 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CXCL3P19876 AC005523.2-201ENST00000601192 3568 ntTSL 4 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CXCL3P19876 ATXN2L-202ENST00000336783 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CXCL3P19876 SPATA16-201ENST00000351008 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CXCL3P19876 C17orf80-203ENST00000359042 3645 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CXCL3P19876 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CXCL3P19876 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CXCL3P19876 LHX1-201ENST00000614239 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CXCL3P19876 MBNL1-202ENST00000282488 6458 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CXCL3P19876 SEPT9-220ENST00000588690 2919 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CXCL3P19876 DMTN-214ENST00000519907 2658 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CXCL3P19876 C22orf34-204ENST00000414287 2197 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CXCL3P19876 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CXCL3P19876 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CXCL3P19876 PIDD1-201ENST00000347755 2998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CXCL3P19876 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CXCL3P19876 POLR2E-211ENST00000612655 1749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CXCL3P19876 UHRF1BP1-202ENST00000452449 4706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CXCL3P19876 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CXCL3P19876 ADRB2-201ENST00000305988 3443 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CXCL3P19876 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CXCL3P19876 SEMA3G-201ENST00000231721 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CXCL3P19876 AC099521.3-201ENST00000624251 2938 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
CXCL3P19876 UGT3A2-201ENST00000282507 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CXCL3P19876 POLL-205ENST00000370169 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CXCL3P19876 MLXIPL-203ENST00000354613 3215 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CXCL3P19876 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CXCL3P19876 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CXCL3P19876 LETMD1-201ENST00000262055 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CXCL3P19876 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CXCL3P19876 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CXCL3P19876 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CXCL3P19876 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
CXCL3P19876 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CXCL3P19876 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CXCL3P19876 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CXCL3P19876 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CXCL3P19876 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CXCL3P19876 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CXCL3P19876 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
CXCL3P19876 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
CXCL3P19876 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CXCL3P19876 FGR-203ENST00000374005 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CXCL3P19876 ITPK1-207ENST00000555495 3035 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CXCL3P19876 IGDCC3-201ENST00000327987 4479 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CXCL3P19876 GSPT1-202ENST00000434724 7105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CXCL3P19876 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CXCL3P19876 HSPA7-201ENST00000445535 1927 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
CXCL3P19876 CNTFR-204ENST00000610543 1926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CXCL3P19876 POLR2E-213ENST00000615234 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CXCL3P19876 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CXCL3P19876 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CXCL3P19876 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CXCL3P19876 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CXCL3P19876 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
CXCL3P19876 TMEM117-207ENST00000551577 2643 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CXCL3P19876 SLC37A4-216ENST00000538950 2032 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CXCL3P19876 CD6-201ENST00000313421 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CXCL3P19876 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CXCL3P19876 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CXCL3P19876 DBN1-203ENST00000393565 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CXCL3P19876 KCNT1-209ENST00000490355 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CXCL3P19876 LANCL2-201ENST00000254770 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CXCL3P19876 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CXCL3P19876 PTPRN-201ENST00000295718 3784 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CXCL3P19876 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CXCL3P19876 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CXCL3P19876 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CXCL3P19876 ST20-AS1-201ENST00000560255 4223 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
CXCL3P19876 AC126365.1-201ENST00000578585 1514 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
CXCL3P19876 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CXCL3P19876 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CXCL3P19876 TMEM184B-202ENST00000361906 3611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CXCL3P19876 ATP13A2-202ENST00000341676 3681 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CXCL3P19876 MAD1L1-204ENST00000406869 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CXCL3P19876 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CXCL3P19876 CUX1-215ENST00000556210 4044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CXCL3P19876 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CXCL3P19876 SCUBE2-201ENST00000309263 3727 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CXCL3P19876 PCNX1-202ENST00000439984 6988 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CXCL3P19876 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CXCL3P19876 HGNC:18790-202ENST00000421177 4172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CXCL3P19876 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CXCL3P19876 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CXCL3P19876 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CXCL3P19876 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
CXCL3P19876 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CXCL3P19876 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CXCL3P19876 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
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