Protein–RNA interactions for Protein: P16871

IL7R, Interleukin-7 receptor subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 459 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IL7RP16871 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
IL7RP16871 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
IL7RP16871 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
IL7RP16871 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
IL7RP16871 CSAD-202ENST00000379843 2086 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
IL7RP16871 BICDL1-201ENST00000397558 3055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
IL7RP16871 KCTD15-201ENST00000284006 4918 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
IL7RP16871 MFRP-205ENST00000619721 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
IL7RP16871 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
IL7RP16871 KCNT1-211ENST00000491806 3678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
IL7RP16871 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
IL7RP16871 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
IL7RP16871 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
IL7RP16871 ZNF497-201ENST00000311044 3468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
IL7RP16871 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
IL7RP16871 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
IL7RP16871 GRIN2A-201ENST00000330684 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
IL7RP16871 PTPRH-201ENST00000263434 3343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
IL7RP16871 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
IL7RP16871 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
IL7RP16871 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
IL7RP16871 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
IL7RP16871 JPH4-205ENST00000622501 3489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
IL7RP16871 ALDH3A2-221ENST00000581518 2785 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
IL7RP16871 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
IL7RP16871 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
IL7RP16871 TNXB-209ENST00000613214 6842 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
IL7RP16871 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
IL7RP16871 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
IL7RP16871 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
IL7RP16871 TTC22-202ENST00000371276 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
IL7RP16871 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
IL7RP16871 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
IL7RP16871 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
IL7RP16871 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
IL7RP16871 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
IL7RP16871 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
IL7RP16871 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
IL7RP16871 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
IL7RP16871 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
IL7RP16871 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
IL7RP16871 TAP2-205ENST00000620123 5676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
IL7RP16871 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
IL7RP16871 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
IL7RP16871 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
IL7RP16871 SLC8B1-201ENST00000202831 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
IL7RP16871 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
IL7RP16871 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
IL7RP16871 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
IL7RP16871 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
IL7RP16871 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
IL7RP16871 DIAPH2-204ENST00000373054 3376 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
IL7RP16871 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
IL7RP16871 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
IL7RP16871 NACAD-202ENST00000490531 4780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
IL7RP16871 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
IL7RP16871 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
IL7RP16871 CNGB1-201ENST00000251102 5641 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
IL7RP16871 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
IL7RP16871 ZSWIM8-201ENST00000398706 6062 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
IL7RP16871 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
IL7RP16871 F2RL1-201ENST00000296677 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
IL7RP16871 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
IL7RP16871 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
IL7RP16871 ARHGAP39-201ENST00000276826 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
IL7RP16871 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
IL7RP16871 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
IL7RP16871 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
IL7RP16871 AC138904.3-201ENST00000635780 2681 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
IL7RP16871 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
IL7RP16871 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
IL7RP16871 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
IL7RP16871 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
IL7RP16871 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
IL7RP16871 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
IL7RP16871 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
IL7RP16871 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
IL7RP16871 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
IL7RP16871 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
IL7RP16871 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
IL7RP16871 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
IL7RP16871 BRF1-211ENST00000547530 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
IL7RP16871 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
IL7RP16871 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
IL7RP16871 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
IL7RP16871 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
IL7RP16871 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
IL7RP16871 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
IL7RP16871 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
IL7RP16871 CACNA1G-205ENST00000360761 7497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
IL7RP16871 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
IL7RP16871 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
IL7RP16871 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
IL7RP16871 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
IL7RP16871 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
IL7RP16871 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
IL7RP16871 PMS1-221ENST00000624204 3417 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
IL7RP16871 ACBD5-202ENST00000375897 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
IL7RP16871 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
IL7RP16871 RBM47-202ENST00000381793 4816 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms