Protein–RNA interactions for Protein: P16422

EPCAM, Epithelial cell adhesion molecule, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPCAMP16422 PNMA3-202ENST00000593810 1432 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
EPCAMP16422 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
EPCAMP16422 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
EPCAMP16422 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
EPCAMP16422 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
EPCAMP16422 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
EPCAMP16422 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
EPCAMP16422 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
EPCAMP16422 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
EPCAMP16422 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
EPCAMP16422 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
EPCAMP16422 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
EPCAMP16422 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
EPCAMP16422 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
EPCAMP16422 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
EPCAMP16422 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
EPCAMP16422 UPK3A-201ENST00000216211 1051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
EPCAMP16422 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
EPCAMP16422 SS18L1-202ENST00000370848 1238 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
EPCAMP16422 GZMB-202ENST00000382540 816 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
EPCAMP16422 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
EPCAMP16422 DERL3-204ENST00000406855 1063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
EPCAMP16422 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
EPCAMP16422 GEMIN4-202ENST00000437269 1182 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
EPCAMP16422 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
EPCAMP16422 CEP57L1-208ENST00000519095 908 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
EPCAMP16422 CD74-212ENST00000524315 584 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
EPCAMP16422 GNAL-204ENST00000535121 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
EPCAMP16422 AP000812.2-201ENST00000538934 718 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
EPCAMP16422 AL118558.1-202ENST00000557242 451 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
EPCAMP16422 LYSMD2-204ENST00000560491 1026 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
EPCAMP16422 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
EPCAMP16422 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
EPCAMP16422 FP565260.6-205ENST00000624120 898 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
EPCAMP16422 AC006453.2-202ENST00000635968 827 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
EPCAMP16422 AC114737.3-201ENST00000636708 570 ntTSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
EPCAMP16422 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
EPCAMP16422 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
EPCAMP16422 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
EPCAMP16422 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
EPCAMP16422 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
EPCAMP16422 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
EPCAMP16422 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
EPCAMP16422 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
EPCAMP16422 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
EPCAMP16422 ARFIP1-202ENST00000356064 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
EPCAMP16422 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
EPCAMP16422 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
EPCAMP16422 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
EPCAMP16422 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
EPCAMP16422 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
EPCAMP16422 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
EPCAMP16422 ACP2-205ENST00000527256 1499 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
EPCAMP16422 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
EPCAMP16422 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
EPCAMP16422 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
EPCAMP16422 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
EPCAMP16422 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
EPCAMP16422 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
EPCAMP16422 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
EPCAMP16422 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
EPCAMP16422 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
EPCAMP16422 LCE1E-202ENST00000368771 575 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
EPCAMP16422 ZG16B-201ENST00000382280 831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
EPCAMP16422 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
EPCAMP16422 RPL13AP25-201ENST00000484130 612 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
EPCAMP16422 AC106786.2-201ENST00000506859 561 ntTSL 4 BASIC16.68■□□□□ 0.26
EPCAMP16422 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
EPCAMP16422 AC008011.2-201ENST00000538113 792 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
EPCAMP16422 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
EPCAMP16422 LINC01089-209ENST00000542933 1220 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
EPCAMP16422 AP001453.3-201ENST00000545800 853 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
EPCAMP16422 AC046168.2-201ENST00000560590 875 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
EPCAMP16422 AC010491.1-202ENST00000567048 528 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
EPCAMP16422 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
EPCAMP16422 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
EPCAMP16422 USE1-206ENST00000595101 1776 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
EPCAMP16422 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
EPCAMP16422 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
EPCAMP16422 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
EPCAMP16422 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
EPCAMP16422 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
EPCAMP16422 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
EPCAMP16422 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
EPCAMP16422 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
EPCAMP16422 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
EPCAMP16422 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
EPCAMP16422 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
EPCAMP16422 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
EPCAMP16422 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
EPCAMP16422 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
EPCAMP16422 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
EPCAMP16422 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
EPCAMP16422 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
EPCAMP16422 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
EPCAMP16422 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
EPCAMP16422 PRG2-202ENST00000525955 1367 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
EPCAMP16422 AC020907.1-201ENST00000616460 1350 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
EPCAMP16422 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
EPCAMP16422 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.8 ms