Protein–RNA interactions for Protein: P12814

ACTN1, Alpha-actinin-1, humanhuman

Predictions only

Length 892 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTN1P12814 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ACTN1P12814 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ACTN1P12814 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ACTN1P12814 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ACTN1P12814 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ACTN1P12814 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ACTN1P12814 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ACTN1P12814 SS18L2-201ENST00000011691 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ACTN1P12814 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ACTN1P12814 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ACTN1P12814 CTHRC1-201ENST00000330295 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ACTN1P12814 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ACTN1P12814 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ACTN1P12814 MACROD2-AS1-201ENST00000439451 1230 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ACTN1P12814 DLX2-AS1-201ENST00000448117 950 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ACTN1P12814 INE1-201ENST00000456273 945 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
ACTN1P12814 AL354710.2-201ENST00000468244 550 ntTSL 4 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ACTN1P12814 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ACTN1P12814 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ACTN1P12814 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ACTN1P12814 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ACTN1P12814 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ACTN1P12814 AL031056.2-201ENST00000637957 1217 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ACTN1P12814 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ACTN1P12814 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ACTN1P12814 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ACTN1P12814 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ACTN1P12814 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ACTN1P12814 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ACTN1P12814 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ACTN1P12814 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ACTN1P12814 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ACTN1P12814 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ACTN1P12814 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ACTN1P12814 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ACTN1P12814 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ACTN1P12814 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ACTN1P12814 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ACTN1P12814 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ACTN1P12814 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ACTN1P12814 YBEY-202ENST00000339195 890 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ACTN1P12814 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ACTN1P12814 YBEY-203ENST00000397691 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ACTN1P12814 AL512384.1-201ENST00000406683 331 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
ACTN1P12814 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ACTN1P12814 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ACTN1P12814 H2AFV-207ENST00000446531 1041 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ACTN1P12814 HHEX-203ENST00000492654 808 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ACTN1P12814 POLE2-203ENST00000553805 496 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ACTN1P12814 EMC4-203ENST00000557879 1009 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ACTN1P12814 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ACTN1P12814 AL162274.1-201ENST00000617191 1098 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
ACTN1P12814 CREB3L2-208ENST00000620715 1053 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ACTN1P12814 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
ACTN1P12814 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ACTN1P12814 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ACTN1P12814 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ACTN1P12814 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ACTN1P12814 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ACTN1P12814 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ACTN1P12814 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ACTN1P12814 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ACTN1P12814 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ACTN1P12814 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ACTN1P12814 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ACTN1P12814 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ACTN1P12814 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ACTN1P12814 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ACTN1P12814 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ACTN1P12814 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ACTN1P12814 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ACTN1P12814 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ACTN1P12814 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ACTN1P12814 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
ACTN1P12814 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ACTN1P12814 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ACTN1P12814 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ACTN1P12814 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ACTN1P12814 LCN15-201ENST00000316144 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ACTN1P12814 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ACTN1P12814 DGCR5-201ENST00000399539 862 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
ACTN1P12814 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ACTN1P12814 TGFA-205ENST00000444975 985 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ACTN1P12814 AC005520.2-201ENST00000556194 573 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ACTN1P12814 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ACTN1P12814 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
ACTN1P12814 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
ACTN1P12814 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ACTN1P12814 IGHV3-72-202ENST00000621503 303 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
ACTN1P12814 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ACTN1P12814 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
ACTN1P12814 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ACTN1P12814 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ACTN1P12814 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ACTN1P12814 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ACTN1P12814 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ACTN1P12814 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ACTN1P12814 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ACTN1P12814 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ACTN1P12814 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.4 ms