Protein–RNA interactions for Protein: P0DMS9

TMIGD3, Transmembrane domain-containing protein TMIGD3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 266 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMIGD3P0DMS9 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TMIGD3P0DMS9 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TMIGD3P0DMS9 FBXO46-201ENST00000317683 3001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TMIGD3P0DMS9 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TMIGD3P0DMS9 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TMIGD3P0DMS9 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TMIGD3P0DMS9 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TMIGD3P0DMS9 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TMIGD3P0DMS9 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TMIGD3P0DMS9 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TMIGD3P0DMS9 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TMIGD3P0DMS9 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TMIGD3P0DMS9 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
TMIGD3P0DMS9 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TMIGD3P0DMS9 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TMIGD3P0DMS9 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
TMIGD3P0DMS9 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TMIGD3P0DMS9 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TMIGD3P0DMS9 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TMIGD3P0DMS9 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TMIGD3P0DMS9 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TMIGD3P0DMS9 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
TMIGD3P0DMS9 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
TMIGD3P0DMS9 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TMIGD3P0DMS9 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TMIGD3P0DMS9 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
TMIGD3P0DMS9 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TMIGD3P0DMS9 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TMIGD3P0DMS9 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TMIGD3P0DMS9 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TMIGD3P0DMS9 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TMIGD3P0DMS9 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TMIGD3P0DMS9 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TMIGD3P0DMS9 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TMIGD3P0DMS9 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TMIGD3P0DMS9 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TMIGD3P0DMS9 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TMIGD3P0DMS9 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TMIGD3P0DMS9 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TMIGD3P0DMS9 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
TMIGD3P0DMS9 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TMIGD3P0DMS9 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TMIGD3P0DMS9 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TMIGD3P0DMS9 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TMIGD3P0DMS9 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TMIGD3P0DMS9 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TMIGD3P0DMS9 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TMIGD3P0DMS9 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TMIGD3P0DMS9 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TMIGD3P0DMS9 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TMIGD3P0DMS9 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
TMIGD3P0DMS9 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TMIGD3P0DMS9 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TMIGD3P0DMS9 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TMIGD3P0DMS9 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TMIGD3P0DMS9 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TMIGD3P0DMS9 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TMIGD3P0DMS9 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TMIGD3P0DMS9 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TMIGD3P0DMS9 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TMIGD3P0DMS9 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TMIGD3P0DMS9 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TMIGD3P0DMS9 LMO7-AS1-202ENST00000568735 467 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TMIGD3P0DMS9 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TMIGD3P0DMS9 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
TMIGD3P0DMS9 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TMIGD3P0DMS9 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TMIGD3P0DMS9 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TMIGD3P0DMS9 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TMIGD3P0DMS9 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TMIGD3P0DMS9 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TMIGD3P0DMS9 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TMIGD3P0DMS9 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TMIGD3P0DMS9 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
TMIGD3P0DMS9 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TMIGD3P0DMS9 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TMIGD3P0DMS9 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TMIGD3P0DMS9 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TMIGD3P0DMS9 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TMIGD3P0DMS9 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TMIGD3P0DMS9 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TMIGD3P0DMS9 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TMIGD3P0DMS9 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TMIGD3P0DMS9 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TMIGD3P0DMS9 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TMIGD3P0DMS9 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TMIGD3P0DMS9 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TMIGD3P0DMS9 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TMIGD3P0DMS9 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TMIGD3P0DMS9 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TMIGD3P0DMS9 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TMIGD3P0DMS9 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TMIGD3P0DMS9 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TMIGD3P0DMS9 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TMIGD3P0DMS9 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TMIGD3P0DMS9 CALY-203ENST00000368558 825 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TMIGD3P0DMS9 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TMIGD3P0DMS9 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TMIGD3P0DMS9 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TMIGD3P0DMS9 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
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