Protein–RNA interactions for Protein: P0DMQ9

C8orf89, Putative uncharacterized protein C8orf89, humanhuman

Predictions only

Length 161 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C8orf89P0DMQ9 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
C8orf89P0DMQ9 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
C8orf89P0DMQ9 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
C8orf89P0DMQ9 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
C8orf89P0DMQ9 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
C8orf89P0DMQ9 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
C8orf89P0DMQ9 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
C8orf89P0DMQ9 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
C8orf89P0DMQ9 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
C8orf89P0DMQ9 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
C8orf89P0DMQ9 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
C8orf89P0DMQ9 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
C8orf89P0DMQ9 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
C8orf89P0DMQ9 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
C8orf89P0DMQ9 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
C8orf89P0DMQ9 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
C8orf89P0DMQ9 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
C8orf89P0DMQ9 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
C8orf89P0DMQ9 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
C8orf89P0DMQ9 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
C8orf89P0DMQ9 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
C8orf89P0DMQ9 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
C8orf89P0DMQ9 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
C8orf89P0DMQ9 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
C8orf89P0DMQ9 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
C8orf89P0DMQ9 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
C8orf89P0DMQ9 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
C8orf89P0DMQ9 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
C8orf89P0DMQ9 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
C8orf89P0DMQ9 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
C8orf89P0DMQ9 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
C8orf89P0DMQ9 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
C8orf89P0DMQ9 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
C8orf89P0DMQ9 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
C8orf89P0DMQ9 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
C8orf89P0DMQ9 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
C8orf89P0DMQ9 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
C8orf89P0DMQ9 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
C8orf89P0DMQ9 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
C8orf89P0DMQ9 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C8orf89P0DMQ9 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
C8orf89P0DMQ9 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
C8orf89P0DMQ9 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
C8orf89P0DMQ9 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C8orf89P0DMQ9 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
C8orf89P0DMQ9 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C8orf89P0DMQ9 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
C8orf89P0DMQ9 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C8orf89P0DMQ9 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C8orf89P0DMQ9 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C8orf89P0DMQ9 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
C8orf89P0DMQ9 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C8orf89P0DMQ9 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C8orf89P0DMQ9 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C8orf89P0DMQ9 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C8orf89P0DMQ9 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C8orf89P0DMQ9 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
C8orf89P0DMQ9 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
C8orf89P0DMQ9 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
C8orf89P0DMQ9 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
C8orf89P0DMQ9 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
C8orf89P0DMQ9 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
C8orf89P0DMQ9 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
C8orf89P0DMQ9 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C8orf89P0DMQ9 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C8orf89P0DMQ9 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C8orf89P0DMQ9 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C8orf89P0DMQ9 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C8orf89P0DMQ9 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C8orf89P0DMQ9 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
C8orf89P0DMQ9 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
C8orf89P0DMQ9 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C8orf89P0DMQ9 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
C8orf89P0DMQ9 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
C8orf89P0DMQ9 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
C8orf89P0DMQ9 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
C8orf89P0DMQ9 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
C8orf89P0DMQ9 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C8orf89P0DMQ9 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C8orf89P0DMQ9 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
C8orf89P0DMQ9 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C8orf89P0DMQ9 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C8orf89P0DMQ9 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C8orf89P0DMQ9 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C8orf89P0DMQ9 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
C8orf89P0DMQ9 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C8orf89P0DMQ9 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C8orf89P0DMQ9 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
C8orf89P0DMQ9 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C8orf89P0DMQ9 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C8orf89P0DMQ9 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
C8orf89P0DMQ9 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C8orf89P0DMQ9 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
C8orf89P0DMQ9 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
C8orf89P0DMQ9 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
C8orf89P0DMQ9 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
C8orf89P0DMQ9 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
C8orf89P0DMQ9 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
C8orf89P0DMQ9 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
C8orf89P0DMQ9 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.2 ms