Protein–RNA interactions for Protein: P0C2W7

CT47B1, Cancer/testis antigen 47B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 299 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CT47B1P0C2W7 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CT47B1P0C2W7 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
CT47B1P0C2W7 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CT47B1P0C2W7 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CT47B1P0C2W7 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CT47B1P0C2W7 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CT47B1P0C2W7 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CT47B1P0C2W7 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
CT47B1P0C2W7 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
CT47B1P0C2W7 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
CT47B1P0C2W7 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
CT47B1P0C2W7 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CT47B1P0C2W7 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CT47B1P0C2W7 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CT47B1P0C2W7 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CT47B1P0C2W7 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CT47B1P0C2W7 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CT47B1P0C2W7 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CT47B1P0C2W7 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CT47B1P0C2W7 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CT47B1P0C2W7 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CT47B1P0C2W7 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CT47B1P0C2W7 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CT47B1P0C2W7 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CT47B1P0C2W7 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CT47B1P0C2W7 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CT47B1P0C2W7 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CT47B1P0C2W7 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CT47B1P0C2W7 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CT47B1P0C2W7 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CT47B1P0C2W7 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CT47B1P0C2W7 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
CT47B1P0C2W7 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CT47B1P0C2W7 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CT47B1P0C2W7 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CT47B1P0C2W7 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CT47B1P0C2W7 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CT47B1P0C2W7 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CT47B1P0C2W7 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CT47B1P0C2W7 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CT47B1P0C2W7 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CT47B1P0C2W7 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CT47B1P0C2W7 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CT47B1P0C2W7 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CT47B1P0C2W7 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CT47B1P0C2W7 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CT47B1P0C2W7 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CT47B1P0C2W7 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CT47B1P0C2W7 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CT47B1P0C2W7 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CT47B1P0C2W7 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CT47B1P0C2W7 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CT47B1P0C2W7 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CT47B1P0C2W7 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CT47B1P0C2W7 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CT47B1P0C2W7 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CT47B1P0C2W7 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CT47B1P0C2W7 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CT47B1P0C2W7 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
CT47B1P0C2W7 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CT47B1P0C2W7 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CT47B1P0C2W7 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CT47B1P0C2W7 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CT47B1P0C2W7 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CT47B1P0C2W7 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CT47B1P0C2W7 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CT47B1P0C2W7 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CT47B1P0C2W7 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
CT47B1P0C2W7 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CT47B1P0C2W7 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CT47B1P0C2W7 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CT47B1P0C2W7 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CT47B1P0C2W7 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CT47B1P0C2W7 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CT47B1P0C2W7 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CT47B1P0C2W7 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CT47B1P0C2W7 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CT47B1P0C2W7 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
CT47B1P0C2W7 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CT47B1P0C2W7 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CT47B1P0C2W7 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
CT47B1P0C2W7 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CT47B1P0C2W7 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CT47B1P0C2W7 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CT47B1P0C2W7 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CT47B1P0C2W7 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CT47B1P0C2W7 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CT47B1P0C2W7 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CT47B1P0C2W7 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CT47B1P0C2W7 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
CT47B1P0C2W7 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
CT47B1P0C2W7 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CT47B1P0C2W7 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CT47B1P0C2W7 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CT47B1P0C2W7 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CT47B1P0C2W7 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CT47B1P0C2W7 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CT47B1P0C2W7 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
CT47B1P0C2W7 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CT47B1P0C2W7 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
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