Protein–RNA interactions for Protein: O95237

LRAT, Lecithin retinol acyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 230 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRATO95237 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LRATO95237 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LRATO95237 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LRATO95237 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LRATO95237 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LRATO95237 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LRATO95237 NACAD-202ENST00000490531 4780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LRATO95237 ARAP2-201ENST00000303965 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LRATO95237 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LRATO95237 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LRATO95237 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LRATO95237 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LRATO95237 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LRATO95237 NUDT16-203ENST00000537561 5943 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LRATO95237 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LRATO95237 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LRATO95237 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LRATO95237 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LRATO95237 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LRATO95237 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LRATO95237 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LRATO95237 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LRATO95237 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LRATO95237 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LRATO95237 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LRATO95237 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LRATO95237 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
LRATO95237 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LRATO95237 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LRATO95237 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LRATO95237 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LRATO95237 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LRATO95237 HS2ST1-201ENST00000370550 6736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LRATO95237 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LRATO95237 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LRATO95237 CACNA1G-205ENST00000360761 7497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LRATO95237 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LRATO95237 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LRATO95237 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LRATO95237 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LRATO95237 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LRATO95237 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LRATO95237 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LRATO95237 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LRATO95237 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
LRATO95237 LMAN1-201ENST00000251047 5521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LRATO95237 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LRATO95237 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LRATO95237 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
LRATO95237 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LRATO95237 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LRATO95237 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LRATO95237 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
LRATO95237 PPM1B-204ENST00000378551 3877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LRATO95237 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
LRATO95237 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LRATO95237 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LRATO95237 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
LRATO95237 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LRATO95237 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LRATO95237 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
LRATO95237 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
LRATO95237 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
LRATO95237 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
LRATO95237 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
LRATO95237 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
LRATO95237 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
LRATO95237 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LRATO95237 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
LRATO95237 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
LRATO95237 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
LRATO95237 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
LRATO95237 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
LRATO95237 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
LRATO95237 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
LRATO95237 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
LRATO95237 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
LRATO95237 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
LRATO95237 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
LRATO95237 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
LRATO95237 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
LRATO95237 UNKL-201ENST00000248104 4320 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
LRATO95237 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
LRATO95237 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LRATO95237 SLC18A2-201ENST00000298472 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LRATO95237 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LRATO95237 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LRATO95237 NF2-210ENST00000413209 4733 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LRATO95237 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LRATO95237 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LRATO95237 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LRATO95237 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LRATO95237 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LRATO95237 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LRATO95237 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LRATO95237 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LRATO95237 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LRATO95237 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LRATO95237 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LRATO95237 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.3 ms