Protein–RNA interactions for Protein: O75712

GJB3, Gap junction beta-3 protein, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJB3O75712 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GJB3O75712 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GJB3O75712 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GJB3O75712 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GJB3O75712 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GJB3O75712 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GJB3O75712 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GJB3O75712 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GJB3O75712 TEKT2-201ENST00000207457 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GJB3O75712 RABEPK-206ENST00000628863 1537 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GJB3O75712 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GJB3O75712 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GJB3O75712 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GJB3O75712 C12orf10-201ENST00000267103 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GJB3O75712 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GJB3O75712 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GJB3O75712 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GJB3O75712 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GJB3O75712 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GJB3O75712 ARSEP1-201ENST00000420443 635 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
GJB3O75712 U91328.1-201ENST00000437528 223 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
GJB3O75712 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
GJB3O75712 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GJB3O75712 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GJB3O75712 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
GJB3O75712 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GJB3O75712 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GJB3O75712 AC008378.1-201ENST00000521251 496 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GJB3O75712 STMN4-207ENST00000523048 1224 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GJB3O75712 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GJB3O75712 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GJB3O75712 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GJB3O75712 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
GJB3O75712 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GJB3O75712 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GJB3O75712 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GJB3O75712 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GJB3O75712 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GJB3O75712 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GJB3O75712 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GJB3O75712 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GJB3O75712 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GJB3O75712 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GJB3O75712 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GJB3O75712 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GJB3O75712 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GJB3O75712 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GJB3O75712 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GJB3O75712 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GJB3O75712 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GJB3O75712 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
GJB3O75712 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GJB3O75712 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GJB3O75712 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GJB3O75712 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GJB3O75712 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GJB3O75712 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GJB3O75712 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GJB3O75712 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GJB3O75712 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GJB3O75712 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GJB3O75712 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GJB3O75712 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GJB3O75712 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GJB3O75712 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GJB3O75712 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GJB3O75712 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GJB3O75712 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GJB3O75712 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GJB3O75712 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GJB3O75712 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GJB3O75712 HNRNPA3P1-201ENST00000401429 1139 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
GJB3O75712 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GJB3O75712 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
GJB3O75712 HNRNPA3P5-201ENST00000455201 833 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
GJB3O75712 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GJB3O75712 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GJB3O75712 SLC8B1-206ENST00000549069 1058 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GJB3O75712 AC026471.2-201ENST00000569782 655 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GJB3O75712 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GJB3O75712 UBE2E3-205ENST00000602475 602 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GJB3O75712 ZNF655-225ENST00000626122 705 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GJB3O75712 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GJB3O75712 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GJB3O75712 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GJB3O75712 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GJB3O75712 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GJB3O75712 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GJB3O75712 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GJB3O75712 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GJB3O75712 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GJB3O75712 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GJB3O75712 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GJB3O75712 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
GJB3O75712 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
GJB3O75712 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GJB3O75712 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GJB3O75712 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GJB3O75712 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GJB3O75712 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms