Protein–RNA interactions for Protein: O75600

GCAT, 2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 419 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCATO75600 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GCATO75600 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
GCATO75600 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GCATO75600 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GCATO75600 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GCATO75600 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GCATO75600 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GCATO75600 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GCATO75600 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
GCATO75600 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GCATO75600 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
GCATO75600 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GCATO75600 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GCATO75600 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GCATO75600 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GCATO75600 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GCATO75600 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
GCATO75600 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GCATO75600 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GCATO75600 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GCATO75600 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GCATO75600 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GCATO75600 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GCATO75600 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GCATO75600 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
GCATO75600 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GCATO75600 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GCATO75600 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GCATO75600 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GCATO75600 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GCATO75600 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GCATO75600 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GCATO75600 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GCATO75600 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GCATO75600 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GCATO75600 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GCATO75600 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GCATO75600 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GCATO75600 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
GCATO75600 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
GCATO75600 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GCATO75600 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
GCATO75600 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
GCATO75600 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GCATO75600 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GCATO75600 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
GCATO75600 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GCATO75600 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GCATO75600 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GCATO75600 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GCATO75600 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GCATO75600 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GCATO75600 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GCATO75600 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
GCATO75600 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GCATO75600 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GCATO75600 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GCATO75600 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GCATO75600 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GCATO75600 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GCATO75600 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GCATO75600 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GCATO75600 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GCATO75600 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GCATO75600 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GCATO75600 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GCATO75600 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GCATO75600 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GCATO75600 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GCATO75600 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
GCATO75600 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
GCATO75600 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
GCATO75600 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
GCATO75600 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
GCATO75600 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
GCATO75600 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
GCATO75600 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
GCATO75600 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
GCATO75600 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
GCATO75600 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
GCATO75600 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
GCATO75600 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
GCATO75600 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
GCATO75600 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
GCATO75600 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
GCATO75600 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
GCATO75600 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
GCATO75600 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
GCATO75600 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
GCATO75600 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
GCATO75600 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
GCATO75600 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
GCATO75600 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
GCATO75600 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
GCATO75600 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
GCATO75600 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
GCATO75600 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
GCATO75600 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
GCATO75600 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
GCATO75600 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.2 ms