Protein–RNA interactions for Protein: O75461

E2F6, Transcription factor E2F6, humanhuman

Predictions only

Length 281 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F6O75461 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
E2F6O75461 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
E2F6O75461 FUK-201ENST00000288078 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
E2F6O75461 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
E2F6O75461 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
E2F6O75461 TOP3B-201ENST00000357179 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
E2F6O75461 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
E2F6O75461 ZBTB17-202ENST00000375743 2745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
E2F6O75461 SACM1L-201ENST00000389061 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
E2F6O75461 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
E2F6O75461 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
E2F6O75461 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
E2F6O75461 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
E2F6O75461 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
E2F6O75461 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
E2F6O75461 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
E2F6O75461 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
E2F6O75461 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
E2F6O75461 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
E2F6O75461 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
E2F6O75461 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
E2F6O75461 ERLIN2-205ENST00000518586 2623 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
E2F6O75461 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
E2F6O75461 DEF8-210ENST00000563594 4450 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
E2F6O75461 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
E2F6O75461 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
E2F6O75461 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
E2F6O75461 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
E2F6O75461 AUTS2-217ENST00000611706 4583 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
E2F6O75461 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
E2F6O75461 ADAR-202ENST00000368474 6625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
E2F6O75461 MARK3-202ENST00000303622 3283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
E2F6O75461 ZNF559-202ENST00000393883 5095 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
E2F6O75461 SPAG6-201ENST00000313311 2421 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
E2F6O75461 DLGAP1-214ENST00000539435 2402 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
E2F6O75461 RBM47-203ENST00000381795 4473 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
E2F6O75461 SLC9A3P3-201ENST00000457608 2229 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
E2F6O75461 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
E2F6O75461 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
E2F6O75461 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
E2F6O75461 FBXL19-202ENST00000380310 3796 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
E2F6O75461 HMOX2-204ENST00000414777 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
E2F6O75461 PRMT9-201ENST00000322396 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
E2F6O75461 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
E2F6O75461 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
E2F6O75461 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
E2F6O75461 SYNRG-217ENST00000612223 8229 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
E2F6O75461 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
E2F6O75461 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
E2F6O75461 FBN3-205ENST00000600128 9362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
E2F6O75461 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
E2F6O75461 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
E2F6O75461 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
E2F6O75461 IL17RA-201ENST00000319363 8607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
E2F6O75461 AKAP12-204ENST00000402676 8432 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
E2F6O75461 SLC35C1-201ENST00000314134 4171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
E2F6O75461 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
E2F6O75461 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
E2F6O75461 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
E2F6O75461 LRRN1-201ENST00000319331 3823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
E2F6O75461 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
E2F6O75461 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
E2F6O75461 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
E2F6O75461 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
E2F6O75461 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
E2F6O75461 POFUT2-214ENST00000615172 2472 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
E2F6O75461 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
E2F6O75461 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
E2F6O75461 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
E2F6O75461 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
E2F6O75461 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
E2F6O75461 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
E2F6O75461 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
E2F6O75461 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
E2F6O75461 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
E2F6O75461 GLIDR-204ENST00000638724 1765 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
E2F6O75461 SLIT1-201ENST00000266058 7925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
E2F6O75461 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
E2F6O75461 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
E2F6O75461 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
E2F6O75461 AL139082.1-201ENST00000613982 3433 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
E2F6O75461 AP002990.1-202ENST00000496634 5064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
E2F6O75461 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
E2F6O75461 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
E2F6O75461 PHF24-201ENST00000242315 5718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
E2F6O75461 SOCS5-202ENST00000394861 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
E2F6O75461 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
E2F6O75461 WNT16-201ENST00000222462 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
E2F6O75461 MLX-202ENST00000346833 2334 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
E2F6O75461 THSD4-202ENST00000355327 9200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
E2F6O75461 TJP3-207ENST00000589378 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
E2F6O75461 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
E2F6O75461 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
E2F6O75461 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
E2F6O75461 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
E2F6O75461 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
E2F6O75461 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
E2F6O75461 EIF4G1-201ENST00000342981 5667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
E2F6O75461 LINC00926-202ENST00000502027 2141 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
E2F6O75461 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms