Protein–RNA interactions for Protein: O43524

FOXO3, Forkhead box protein O3, humanhuman

Predictions only

Length 673 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXO3O43524 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
FOXO3O43524 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
FOXO3O43524 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
FOXO3O43524 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
FOXO3O43524 UBE3B-212ENST00000540230 1541 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
FOXO3O43524 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
FOXO3O43524 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
FOXO3O43524 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
FOXO3O43524 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
FOXO3O43524 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
FOXO3O43524 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
FOXO3O43524 IP6K2-202ENST00000340879 1185 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
FOXO3O43524 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
FOXO3O43524 WDR3-202ENST00000369441 1035 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
FOXO3O43524 ITPA-201ENST00000380113 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
FOXO3O43524 MTHFSD-202ENST00000381214 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
FOXO3O43524 ITPA-202ENST00000399838 897 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
FOXO3O43524 BLVRA-202ENST00000402924 1161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
FOXO3O43524 AC128709.2-201ENST00000438408 558 ntTSL 4 BASIC21.69■■□□□ 1.06
FOXO3O43524 AC096536.1-201ENST00000443284 440 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
FOXO3O43524 AL160290.2-201ENST00000448347 831 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
FOXO3O43524 METTL6-204ENST00000450816 1221 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
FOXO3O43524 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
FOXO3O43524 ANAPC11-215ENST00000578550 599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
FOXO3O43524 IGFLR1-211ENST00000592889 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
FOXO3O43524 LINC00658-206ENST00000600157 901 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
FOXO3O43524 AC007326.5-201ENST00000640084 1382 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
FOXO3O43524 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
FOXO3O43524 CHI3L2-212ENST00000524472 1435 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
FOXO3O43524 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
FOXO3O43524 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
FOXO3O43524 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
FOXO3O43524 CCNA1-204ENST00000630422 1751 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
FOXO3O43524 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
FOXO3O43524 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
FOXO3O43524 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
FOXO3O43524 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
FOXO3O43524 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
FOXO3O43524 RPS3-201ENST00000278572 907 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
FOXO3O43524 CYTL1-201ENST00000307746 1003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
FOXO3O43524 BTBD6P1-201ENST00000412176 1267 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
FOXO3O43524 FAM197Y7-201ENST00000432892 766 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
FOXO3O43524 DGUOK-AS1-202ENST00000439192 563 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
FOXO3O43524 HYAL3-206ENST00000513170 636 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
FOXO3O43524 AC078819.1-201ENST00000547454 765 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
FOXO3O43524 AC012085.1-201ENST00000548270 765 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
FOXO3O43524 AC091891.1-201ENST00000560688 688 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
FOXO3O43524 LINC01515-215ENST00000608678 854 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
FOXO3O43524 AC005695.3-201ENST00000614522 232 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
FOXO3O43524 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
FOXO3O43524 AC233723.1-201ENST00000635921 386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
FOXO3O43524 AC244452.3-201ENST00000636814 210 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
FOXO3O43524 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
FOXO3O43524 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
FOXO3O43524 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
FOXO3O43524 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
FOXO3O43524 ST7L-207ENST00000369669 1743 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
FOXO3O43524 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
FOXO3O43524 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
FOXO3O43524 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
FOXO3O43524 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
FOXO3O43524 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
FOXO3O43524 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
FOXO3O43524 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
FOXO3O43524 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
FOXO3O43524 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
FOXO3O43524 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
FOXO3O43524 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
FOXO3O43524 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
FOXO3O43524 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
FOXO3O43524 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
FOXO3O43524 UCP3-202ENST00000426995 1406 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
FOXO3O43524 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
FOXO3O43524 CD79A-201ENST00000221972 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
FOXO3O43524 BOLA3-201ENST00000295326 444 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
FOXO3O43524 LSM10-201ENST00000315732 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
FOXO3O43524 TREM2-203ENST00000373122 1012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
FOXO3O43524 ZNF248-202ENST00000374648 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
FOXO3O43524 TMEM52-203ENST00000378602 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
FOXO3O43524 GTF2H2-204ENST00000517900 659 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
FOXO3O43524 IFT20-206ENST00000578122 834 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
FOXO3O43524 IFT20-208ENST00000578985 831 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
FOXO3O43524 RBM8A-206ENST00000632555 751 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
FOXO3O43524 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
FOXO3O43524 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
FOXO3O43524 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
FOXO3O43524 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
FOXO3O43524 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
FOXO3O43524 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
FOXO3O43524 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
FOXO3O43524 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
FOXO3O43524 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
FOXO3O43524 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
FOXO3O43524 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
FOXO3O43524 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
FOXO3O43524 ARRB2-204ENST00000412477 1779 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
FOXO3O43524 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
FOXO3O43524 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
FOXO3O43524 ECHDC2-203ENST00000371522 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
FOXO3O43524 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.4 ms