Protein–RNA interactions for Protein: O43300

LRRTM2, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 2, humanhuman

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Length 516 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRTM2O43300 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LRRTM2O43300 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LRRTM2O43300 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LRRTM2O43300 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LRRTM2O43300 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LRRTM2O43300 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LRRTM2O43300 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LRRTM2O43300 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LRRTM2O43300 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LRRTM2O43300 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LRRTM2O43300 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LRRTM2O43300 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LRRTM2O43300 AL807752.4-201ENST00000439076 580 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LRRTM2O43300 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LRRTM2O43300 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LRRTM2O43300 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LRRTM2O43300 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LRRTM2O43300 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LRRTM2O43300 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LRRTM2O43300 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
LRRTM2O43300 AC027307.3-201ENST00000594262 1100 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
LRRTM2O43300 AL008721.1-201ENST00000609964 604 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
LRRTM2O43300 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LRRTM2O43300 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LRRTM2O43300 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LRRTM2O43300 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LRRTM2O43300 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LRRTM2O43300 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LRRTM2O43300 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LRRTM2O43300 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LRRTM2O43300 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LRRTM2O43300 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LRRTM2O43300 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LRRTM2O43300 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LRRTM2O43300 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LRRTM2O43300 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LRRTM2O43300 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LRRTM2O43300 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LRRTM2O43300 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LRRTM2O43300 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LRRTM2O43300 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LRRTM2O43300 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LRRTM2O43300 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LRRTM2O43300 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
LRRTM2O43300 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LRRTM2O43300 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
LRRTM2O43300 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
LRRTM2O43300 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LRRTM2O43300 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LRRTM2O43300 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LRRTM2O43300 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LRRTM2O43300 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
LRRTM2O43300 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
LRRTM2O43300 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LRRTM2O43300 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LRRTM2O43300 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
LRRTM2O43300 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
LRRTM2O43300 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
LRRTM2O43300 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
LRRTM2O43300 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LRRTM2O43300 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LRRTM2O43300 GOLGA6L11P-201ENST00000417252 1298 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
LRRTM2O43300 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
LRRTM2O43300 RAB3A-202ENST00000464076 1253 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
LRRTM2O43300 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
LRRTM2O43300 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
LRRTM2O43300 AP005018.1-201ENST00000525475 301 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
LRRTM2O43300 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC15.14■□□□□ 0.01
LRRTM2O43300 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
LRRTM2O43300 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
LRRTM2O43300 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LRRTM2O43300 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LRRTM2O43300 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
LRRTM2O43300 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
LRRTM2O43300 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LRRTM2O43300 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
LRRTM2O43300 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
LRRTM2O43300 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
LRRTM2O43300 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LRRTM2O43300 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LRRTM2O43300 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LRRTM2O43300 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LRRTM2O43300 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LRRTM2O43300 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
LRRTM2O43300 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LRRTM2O43300 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LRRTM2O43300 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LRRTM2O43300 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
LRRTM2O43300 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LRRTM2O43300 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LRRTM2O43300 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LRRTM2O43300 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LRRTM2O43300 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
LRRTM2O43300 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
LRRTM2O43300 TNFRSF14-AS1-201ENST00000416860 3522 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
LRRTM2O43300 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
LRRTM2O43300 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LRRTM2O43300 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LRRTM2O43300 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
LRRTM2O43300 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
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