Protein–RNA interactions for Protein: O00559

EBAG9, Receptor-binding cancer antigen expressed on SiSo cells, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EBAG9O00559 KIAA0895L-201ENST00000290881 3550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
EBAG9O00559 SV2A-201ENST00000369145 2903 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
EBAG9O00559 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
EBAG9O00559 CAMK2D-204ENST00000394522 2696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
EBAG9O00559 PRKAG2-215ENST00000492843 2699 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
EBAG9O00559 FAM84B-201ENST00000304916 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
EBAG9O00559 SFXN3-201ENST00000224807 3089 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
EBAG9O00559 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
EBAG9O00559 DGCR9-201ENST00000609630 2415 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
EBAG9O00559 AC004890.2-205ENST00000416232 2804 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
EBAG9O00559 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
EBAG9O00559 PRKY-203ENST00000528056 7218 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
EBAG9O00559 APBB1-217ENST00000608645 1925 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
EBAG9O00559 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
EBAG9O00559 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
EBAG9O00559 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
EBAG9O00559 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
EBAG9O00559 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
EBAG9O00559 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
EBAG9O00559 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
EBAG9O00559 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
EBAG9O00559 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
EBAG9O00559 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
EBAG9O00559 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
EBAG9O00559 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
EBAG9O00559 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
EBAG9O00559 WWC2-201ENST00000403733 8826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
EBAG9O00559 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
EBAG9O00559 HIPK3-203ENST00000456517 7399 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
EBAG9O00559 UBA5-202ENST00000356232 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
EBAG9O00559 TUBGCP6-201ENST00000248846 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
EBAG9O00559 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
EBAG9O00559 SPOCK3-202ENST00000357545 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
EBAG9O00559 CYP1A1-210ENST00000617691 2521 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
EBAG9O00559 DMTN-214ENST00000519907 2658 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
EBAG9O00559 CERKL-206ENST00000410087 3208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
EBAG9O00559 FCHO1-206ENST00000594202 3214 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
EBAG9O00559 CAMSAP1-203ENST00000409386 5730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
EBAG9O00559 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
EBAG9O00559 TNFRSF10C-201ENST00000356864 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
EBAG9O00559 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
EBAG9O00559 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
EBAG9O00559 MEIOC-201ENST00000409122 4604 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
EBAG9O00559 NBPF26-208ENST00000620612 4602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
EBAG9O00559 PDE3B-202ENST00000455098 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
EBAG9O00559 NMUR1-201ENST00000305141 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
EBAG9O00559 DBN1-203ENST00000393565 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
EBAG9O00559 ADRB2-201ENST00000305988 3443 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
EBAG9O00559 DNAJC27-207ENST00000534855 4831 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
EBAG9O00559 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
EBAG9O00559 TMCC3-201ENST00000261226 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
EBAG9O00559 BCL9L-201ENST00000334801 10005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
EBAG9O00559 BX640514.1-201ENST00000583223 1918 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
EBAG9O00559 CILP2-202ENST00000586018 4234 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
EBAG9O00559 JPH1-201ENST00000342232 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
EBAG9O00559 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
EBAG9O00559 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
EBAG9O00559 UMODL1-AS1-201ENST00000329015 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
EBAG9O00559 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
EBAG9O00559 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
EBAG9O00559 BAIAP3-202ENST00000397488 4583 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
EBAG9O00559 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
EBAG9O00559 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
EBAG9O00559 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
EBAG9O00559 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC16.15■□□□□ 0.18
EBAG9O00559 GPR132-203ENST00000539291 2779 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
EBAG9O00559 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
EBAG9O00559 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
EBAG9O00559 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
EBAG9O00559 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
EBAG9O00559 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
EBAG9O00559 UNQ6494-202ENST00000617436 2163 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
EBAG9O00559 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
EBAG9O00559 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
EBAG9O00559 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
EBAG9O00559 CD6-201ENST00000313421 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
EBAG9O00559 DSN1-203ENST00000373750 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
EBAG9O00559 LMX1B-202ENST00000373474 5797 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
EBAG9O00559 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
EBAG9O00559 RNF166-210ENST00000568683 1768 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
EBAG9O00559 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
EBAG9O00559 INTS4P1-203ENST00000641008 3683 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
EBAG9O00559 DACH1-204ENST00000620444 4627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
EBAG9O00559 TPD52L2-206ENST00000358548 2275 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
EBAG9O00559 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
EBAG9O00559 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
EBAG9O00559 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
EBAG9O00559 ZNF618-207ENST00000615615 9289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
EBAG9O00559 WHRN-202ENST00000362057 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
EBAG9O00559 FRMD5-201ENST00000402883 4091 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
EBAG9O00559 COL17A1-201ENST00000353479 5734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
EBAG9O00559 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
EBAG9O00559 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
EBAG9O00559 RSPO3-201ENST00000356698 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
EBAG9O00559 ITGB4-203ENST00000450894 5645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
EBAG9O00559 STK40-201ENST00000359297 4837 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
EBAG9O00559 SUOX-201ENST00000266971 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
EBAG9O00559 SIGLEC5-201ENST00000534261 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
EBAG9O00559 GPR68-203ENST00000531499 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
EBAG9O00559 RUNX1T1-246ENST00000523629 7537 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.3 ms