Protein–RNA interactions for Protein: B1AMM8

LINC00587, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00587, humanhuman

Predictions only

Length 73 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00587B1AMM8 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
LINC00587B1AMM8 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
LINC00587B1AMM8 C16orf62-215ENST00000542263 3138 ntTSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
LINC00587B1AMM8 COL8A2-201ENST00000303143 4447 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
LINC00587B1AMM8 CENPBD1-201ENST00000314994 2744 ntAPPRIS P1 BASIC12.14□□□□□ -0.47
LINC00587B1AMM8 TPM3-208ENST00000341485 2063 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
LINC00587B1AMM8 GOLGA2P7-207ENST00000559668 4253 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
LINC00587B1AMM8 POU2F2-204ENST00000526816 3218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
LINC00587B1AMM8 LHX6-204ENST00000394319 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
LINC00587B1AMM8 MTSS1-216ENST00000524090 2166 ntTSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
LINC00587B1AMM8 ADAM19-203ENST00000517905 3312 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
LINC00587B1AMM8 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
LINC00587B1AMM8 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC12.14□□□□□ -0.47
LINC00587B1AMM8 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC12.14□□□□□ -0.47
LINC00587B1AMM8 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
LINC00587B1AMM8 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC12.14□□□□□ -0.47
LINC00587B1AMM8 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
LINC00587B1AMM8 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
LINC00587B1AMM8 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
LINC00587B1AMM8 LMBR1L-201ENST00000267102 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
LINC00587B1AMM8 KCNV1-201ENST00000297404 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
LINC00587B1AMM8 KCTD9-201ENST00000221200 3401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
LINC00587B1AMM8 RHOH-217ENST00000610353 2268 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC12.14□□□□□ -0.47
LINC00587B1AMM8 MDGA1-207ENST00000505425 3021 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
LINC00587B1AMM8 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
LINC00587B1AMM8 AC097359.2-201ENST00000604992 2389 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
LINC00587B1AMM8 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
LINC00587B1AMM8 FBXO42-201ENST00000375592 6202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
LINC00587B1AMM8 SLCO4C1-201ENST00000310954 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
LINC00587B1AMM8 ABCB7-202ENST00000339447 2234 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
LINC00587B1AMM8 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
LINC00587B1AMM8 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
LINC00587B1AMM8 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
LINC00587B1AMM8 TRIM26-267ENST00000453195 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
LINC00587B1AMM8 SPINT1-201ENST00000344051 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
LINC00587B1AMM8 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
LINC00587B1AMM8 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
LINC00587B1AMM8 PDE2A-206ENST00000444035 4193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
LINC00587B1AMM8 CDK2AP1-205ENST00000542174 1812 ntTSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
LINC00587B1AMM8 CICP1-201ENST00000416803 2410 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
LINC00587B1AMM8 MKL1-201ENST00000355630 4496 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
LINC00587B1AMM8 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
LINC00587B1AMM8 FXYD6-201ENST00000260282 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
LINC00587B1AMM8 CCDC186-202ENST00000369286 1928 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
LINC00587B1AMM8 TOP3B-202ENST00000398793 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
LINC00587B1AMM8 SESN2-201ENST00000253063 3453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
LINC00587B1AMM8 HOXB13-201ENST00000290295 3467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
LINC00587B1AMM8 BCL2L1-201ENST00000307677 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
LINC00587B1AMM8 PTPN23-201ENST00000265562 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
LINC00587B1AMM8 SLC37A4-202ENST00000357590 2356 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
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LINC00587B1AMM8 IRS1-201ENST00000305123 9705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
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LINC00587B1AMM8 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
LINC00587B1AMM8 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
LINC00587B1AMM8 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
LINC00587B1AMM8 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
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LINC00587B1AMM8 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
LINC00587B1AMM8 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
LINC00587B1AMM8 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
LINC00587B1AMM8 OSBPL2-201ENST00000313733 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
LINC00587B1AMM8 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
LINC00587B1AMM8 MAMDC4-201ENST00000317446 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
LINC00587B1AMM8 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC12.13□□□□□ -0.47
LINC00587B1AMM8 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
LINC00587B1AMM8 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
LINC00587B1AMM8 ZKSCAN4-201ENST00000377294 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
LINC00587B1AMM8 HGNC:18790-202ENST00000421177 4172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
LINC00587B1AMM8 PDE2A-218ENST00000540345 3027 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
LINC00587B1AMM8 KLHL21-201ENST00000377658 4487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
LINC00587B1AMM8 FGFRL1-201ENST00000264748 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
LINC00587B1AMM8 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
LINC00587B1AMM8 LINC02538-201ENST00000609107 4569 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
LINC00587B1AMM8 HNRNPDL-208ENST00000621267 4139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
LINC00587B1AMM8 DNAH14-204ENST00000366849 2215 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
LINC00587B1AMM8 EBP-205ENST00000495186 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
LINC00587B1AMM8 PAM-203ENST00000346918 3302 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
LINC00587B1AMM8 APBB2-211ENST00000506352 3316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
LINC00587B1AMM8 TMEM147-AS1-205ENST00000590717 3300 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
LINC00587B1AMM8 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
LINC00587B1AMM8 SAMD4B-201ENST00000314471 4519 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
LINC00587B1AMM8 SLC38A7-215ENST00000570101 4549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
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