Protein–RNA interactions for Protein: A8K0Z3

WASHC1, WASH complex subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 465 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WASHC1A8K0Z3 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
WASHC1A8K0Z3 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
WASHC1A8K0Z3 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
WASHC1A8K0Z3 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
WASHC1A8K0Z3 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
WASHC1A8K0Z3 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
WASHC1A8K0Z3 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
WASHC1A8K0Z3 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
WASHC1A8K0Z3 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
WASHC1A8K0Z3 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
WASHC1A8K0Z3 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
WASHC1A8K0Z3 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
WASHC1A8K0Z3 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
WASHC1A8K0Z3 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
WASHC1A8K0Z3 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
WASHC1A8K0Z3 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
WASHC1A8K0Z3 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
WASHC1A8K0Z3 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
WASHC1A8K0Z3 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
WASHC1A8K0Z3 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
WASHC1A8K0Z3 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
WASHC1A8K0Z3 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
WASHC1A8K0Z3 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
WASHC1A8K0Z3 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
WASHC1A8K0Z3 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
WASHC1A8K0Z3 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
WASHC1A8K0Z3 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
WASHC1A8K0Z3 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
WASHC1A8K0Z3 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
WASHC1A8K0Z3 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
WASHC1A8K0Z3 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
WASHC1A8K0Z3 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
WASHC1A8K0Z3 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
WASHC1A8K0Z3 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
WASHC1A8K0Z3 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
WASHC1A8K0Z3 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
WASHC1A8K0Z3 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
WASHC1A8K0Z3 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
WASHC1A8K0Z3 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
WASHC1A8K0Z3 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
WASHC1A8K0Z3 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
WASHC1A8K0Z3 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
WASHC1A8K0Z3 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
WASHC1A8K0Z3 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
WASHC1A8K0Z3 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
WASHC1A8K0Z3 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
WASHC1A8K0Z3 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
WASHC1A8K0Z3 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
WASHC1A8K0Z3 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
WASHC1A8K0Z3 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
WASHC1A8K0Z3 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
WASHC1A8K0Z3 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
WASHC1A8K0Z3 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
WASHC1A8K0Z3 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
WASHC1A8K0Z3 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
WASHC1A8K0Z3 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
WASHC1A8K0Z3 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
WASHC1A8K0Z3 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
WASHC1A8K0Z3 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
WASHC1A8K0Z3 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
WASHC1A8K0Z3 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
WASHC1A8K0Z3 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
WASHC1A8K0Z3 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
WASHC1A8K0Z3 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
WASHC1A8K0Z3 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
WASHC1A8K0Z3 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
WASHC1A8K0Z3 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
WASHC1A8K0Z3 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
WASHC1A8K0Z3 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
WASHC1A8K0Z3 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
WASHC1A8K0Z3 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
WASHC1A8K0Z3 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
WASHC1A8K0Z3 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
WASHC1A8K0Z3 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
WASHC1A8K0Z3 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
WASHC1A8K0Z3 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
WASHC1A8K0Z3 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
WASHC1A8K0Z3 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
WASHC1A8K0Z3 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
WASHC1A8K0Z3 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
WASHC1A8K0Z3 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
WASHC1A8K0Z3 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
WASHC1A8K0Z3 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
WASHC1A8K0Z3 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
WASHC1A8K0Z3 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
WASHC1A8K0Z3 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
WASHC1A8K0Z3 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
WASHC1A8K0Z3 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
WASHC1A8K0Z3 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
WASHC1A8K0Z3 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
WASHC1A8K0Z3 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
WASHC1A8K0Z3 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
WASHC1A8K0Z3 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
WASHC1A8K0Z3 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
WASHC1A8K0Z3 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
WASHC1A8K0Z3 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
WASHC1A8K0Z3 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
WASHC1A8K0Z3 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
WASHC1A8K0Z3 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
WASHC1A8K0Z3 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.2 ms