Protein–RNA interactions for Protein: A6NCF5

KLHL33, Kelch-like protein 33, humanhuman

Predictions only

Length 533 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL33A6NCF5 RUNDC1-201ENST00000361677 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
KLHL33A6NCF5 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
KLHL33A6NCF5 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
KLHL33A6NCF5 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
KLHL33A6NCF5 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
KLHL33A6NCF5 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
KLHL33A6NCF5 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
KLHL33A6NCF5 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
KLHL33A6NCF5 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
KLHL33A6NCF5 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
KLHL33A6NCF5 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
KLHL33A6NCF5 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
KLHL33A6NCF5 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
KLHL33A6NCF5 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
KLHL33A6NCF5 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
KLHL33A6NCF5 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC16.21■□□□□ 0.19
KLHL33A6NCF5 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
KLHL33A6NCF5 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
KLHL33A6NCF5 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
KLHL33A6NCF5 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
KLHL33A6NCF5 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
KLHL33A6NCF5 CCDC183-AS1-201ENST00000414656 2386 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
KLHL33A6NCF5 CD6-201ENST00000313421 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
KLHL33A6NCF5 LONP1-202ENST00000540670 3002 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
KLHL33A6NCF5 NUMBL-201ENST00000252891 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
KLHL33A6NCF5 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC16.21■□□□□ 0.18
KLHL33A6NCF5 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
KLHL33A6NCF5 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
KLHL33A6NCF5 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
KLHL33A6NCF5 TBCD-202ENST00000539345 3975 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
KLHL33A6NCF5 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
KLHL33A6NCF5 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
KLHL33A6NCF5 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
KLHL33A6NCF5 MAPKAP1-201ENST00000265960 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
KLHL33A6NCF5 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
KLHL33A6NCF5 EEF1AKMT3-201ENST00000300209 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
KLHL33A6NCF5 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
KLHL33A6NCF5 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
KLHL33A6NCF5 TNFRSF14-AS1-201ENST00000416860 3522 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
KLHL33A6NCF5 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
KLHL33A6NCF5 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
KLHL33A6NCF5 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
KLHL33A6NCF5 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
KLHL33A6NCF5 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
KLHL33A6NCF5 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
KLHL33A6NCF5 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
KLHL33A6NCF5 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
KLHL33A6NCF5 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
KLHL33A6NCF5 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
KLHL33A6NCF5 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
KLHL33A6NCF5 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
KLHL33A6NCF5 SHTN1-204ENST00000392903 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
KLHL33A6NCF5 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
KLHL33A6NCF5 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
KLHL33A6NCF5 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
KLHL33A6NCF5 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
KLHL33A6NCF5 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
KLHL33A6NCF5 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
KLHL33A6NCF5 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
KLHL33A6NCF5 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
KLHL33A6NCF5 PRPH-201ENST00000257860 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
KLHL33A6NCF5 MAU2-201ENST00000262815 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
KLHL33A6NCF5 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
KLHL33A6NCF5 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
KLHL33A6NCF5 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
KLHL33A6NCF5 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
KLHL33A6NCF5 AC010327.5-201ENST00000586923 3061 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
KLHL33A6NCF5 TJP3-207ENST00000589378 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
KLHL33A6NCF5 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
KLHL33A6NCF5 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
KLHL33A6NCF5 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
KLHL33A6NCF5 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
KLHL33A6NCF5 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
KLHL33A6NCF5 AC123912.2-201ENST00000594927 2409 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
KLHL33A6NCF5 TEAD3-202ENST00000402886 2729 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
KLHL33A6NCF5 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
KLHL33A6NCF5 NLRP13-201ENST00000342929 3132 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
KLHL33A6NCF5 LRCH1-202ENST00000389797 3314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
KLHL33A6NCF5 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
KLHL33A6NCF5 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
KLHL33A6NCF5 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
KLHL33A6NCF5 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
KLHL33A6NCF5 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
KLHL33A6NCF5 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
KLHL33A6NCF5 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
KLHL33A6NCF5 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
KLHL33A6NCF5 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
KLHL33A6NCF5 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
KLHL33A6NCF5 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
KLHL33A6NCF5 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
KLHL33A6NCF5 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
KLHL33A6NCF5 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
KLHL33A6NCF5 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
KLHL33A6NCF5 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
KLHL33A6NCF5 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
KLHL33A6NCF5 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
KLHL33A6NCF5 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
KLHL33A6NCF5 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
KLHL33A6NCF5 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
KLHL33A6NCF5 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.5 ms