Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6C7

LINC00312, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00312, humanhuman

Predictions only

Length 94 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00312Q9Y6C7 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
LINC00312Q9Y6C7 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
LINC00312Q9Y6C7 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
LINC00312Q9Y6C7 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
LINC00312Q9Y6C7 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
LINC00312Q9Y6C7 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
LINC00312Q9Y6C7 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
LINC00312Q9Y6C7 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
LINC00312Q9Y6C7 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
LINC00312Q9Y6C7 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
LINC00312Q9Y6C7 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
LINC00312Q9Y6C7 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
LINC00312Q9Y6C7 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
LINC00312Q9Y6C7 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
LINC00312Q9Y6C7 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
LINC00312Q9Y6C7 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
LINC00312Q9Y6C7 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
LINC00312Q9Y6C7 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
LINC00312Q9Y6C7 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
LINC00312Q9Y6C7 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
LINC00312Q9Y6C7 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
LINC00312Q9Y6C7 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
LINC00312Q9Y6C7 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
LINC00312Q9Y6C7 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
LINC00312Q9Y6C7 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
LINC00312Q9Y6C7 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
LINC00312Q9Y6C7 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
LINC00312Q9Y6C7 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
LINC00312Q9Y6C7 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
LINC00312Q9Y6C7 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
LINC00312Q9Y6C7 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
LINC00312Q9Y6C7 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
LINC00312Q9Y6C7 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
LINC00312Q9Y6C7 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
LINC00312Q9Y6C7 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
LINC00312Q9Y6C7 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
LINC00312Q9Y6C7 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
LINC00312Q9Y6C7 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
LINC00312Q9Y6C7 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
LINC00312Q9Y6C7 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
LINC00312Q9Y6C7 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
LINC00312Q9Y6C7 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
LINC00312Q9Y6C7 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
LINC00312Q9Y6C7 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
LINC00312Q9Y6C7 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
LINC00312Q9Y6C7 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
LINC00312Q9Y6C7 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
LINC00312Q9Y6C7 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
LINC00312Q9Y6C7 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
LINC00312Q9Y6C7 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC13.31□□□□□ -0.28
LINC00312Q9Y6C7 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
LINC00312Q9Y6C7 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
LINC00312Q9Y6C7 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
LINC00312Q9Y6C7 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
LINC00312Q9Y6C7 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
LINC00312Q9Y6C7 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
LINC00312Q9Y6C7 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
LINC00312Q9Y6C7 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
LINC00312Q9Y6C7 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
LINC00312Q9Y6C7 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
LINC00312Q9Y6C7 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
LINC00312Q9Y6C7 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
LINC00312Q9Y6C7 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
LINC00312Q9Y6C7 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
LINC00312Q9Y6C7 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
LINC00312Q9Y6C7 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
LINC00312Q9Y6C7 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
LINC00312Q9Y6C7 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
LINC00312Q9Y6C7 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
LINC00312Q9Y6C7 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
LINC00312Q9Y6C7 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
LINC00312Q9Y6C7 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
LINC00312Q9Y6C7 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
LINC00312Q9Y6C7 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
LINC00312Q9Y6C7 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
LINC00312Q9Y6C7 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
LINC00312Q9Y6C7 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
LINC00312Q9Y6C7 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
LINC00312Q9Y6C7 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
LINC00312Q9Y6C7 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
LINC00312Q9Y6C7 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
LINC00312Q9Y6C7 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
LINC00312Q9Y6C7 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
LINC00312Q9Y6C7 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
LINC00312Q9Y6C7 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
LINC00312Q9Y6C7 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
LINC00312Q9Y6C7 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
LINC00312Q9Y6C7 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC13.3□□□□□ -0.28
LINC00312Q9Y6C7 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
LINC00312Q9Y6C7 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
LINC00312Q9Y6C7 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
LINC00312Q9Y6C7 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
LINC00312Q9Y6C7 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
LINC00312Q9Y6C7 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
LINC00312Q9Y6C7 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
LINC00312Q9Y6C7 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
LINC00312Q9Y6C7 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
LINC00312Q9Y6C7 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
LINC00312Q9Y6C7 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
LINC00312Q9Y6C7 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.9 ms