Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y244

POMP, Proteasome maturation protein, humanhuman

Predictions only

Length 141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POMPQ9Y244 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
POMPQ9Y244 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
POMPQ9Y244 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
POMPQ9Y244 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
POMPQ9Y244 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
POMPQ9Y244 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
POMPQ9Y244 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
POMPQ9Y244 USP28-214ENST00000545540 3431 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
POMPQ9Y244 TMEM38A-201ENST00000187762 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
POMPQ9Y244 KCNC1-201ENST00000265969 4295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
POMPQ9Y244 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
POMPQ9Y244 UHRF1-204ENST00000616255 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
POMPQ9Y244 PSD2-201ENST00000274710 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
POMPQ9Y244 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
POMPQ9Y244 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
POMPQ9Y244 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
POMPQ9Y244 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
POMPQ9Y244 NACC1-201ENST00000292431 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
POMPQ9Y244 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
POMPQ9Y244 BRD2-202ENST00000374831 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
POMPQ9Y244 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
POMPQ9Y244 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
POMPQ9Y244 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
POMPQ9Y244 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
POMPQ9Y244 DCUN1D2-201ENST00000332592 2626 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
POMPQ9Y244 NEDD4L-202ENST00000356462 3335 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
POMPQ9Y244 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
POMPQ9Y244 EID1-201ENST00000530028 2298 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
POMPQ9Y244 PPFIBP1-216ENST00000545334 2805 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
POMPQ9Y244 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
POMPQ9Y244 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
POMPQ9Y244 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
POMPQ9Y244 LPO-210ENST00000582328 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
POMPQ9Y244 GTF2IRD1-201ENST00000265755 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
POMPQ9Y244 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
POMPQ9Y244 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
POMPQ9Y244 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
POMPQ9Y244 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
POMPQ9Y244 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
POMPQ9Y244 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
POMPQ9Y244 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
POMPQ9Y244 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
POMPQ9Y244 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
POMPQ9Y244 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
POMPQ9Y244 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
POMPQ9Y244 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
POMPQ9Y244 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
POMPQ9Y244 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
POMPQ9Y244 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
POMPQ9Y244 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
POMPQ9Y244 JAKMIP1-205ENST00000410077 1835 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
POMPQ9Y244 MEGF10-206ENST00000508365 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
POMPQ9Y244 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
POMPQ9Y244 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
POMPQ9Y244 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
POMPQ9Y244 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
POMPQ9Y244 SYP-201ENST00000263233 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
POMPQ9Y244 AC079336.5-201ENST00000581360 2480 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
POMPQ9Y244 AC126365.1-201ENST00000578585 1514 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
POMPQ9Y244 SLC52A3-205ENST00000632431 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
POMPQ9Y244 KCNT1-207ENST00000487664 3845 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
POMPQ9Y244 KLHL26-201ENST00000300976 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
POMPQ9Y244 ATG4B-206ENST00000405546 3294 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
POMPQ9Y244 NAA60-229ENST00000575076 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
POMPQ9Y244 SLC39A1-204ENST00000368623 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
POMPQ9Y244 GNAO1-201ENST00000262493 3337 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
POMPQ9Y244 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
POMPQ9Y244 AKAP1-201ENST00000314126 2380 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
POMPQ9Y244 NXF1-213ENST00000532297 2795 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
POMPQ9Y244 SYT5-201ENST00000354308 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
POMPQ9Y244 SLC4A3-202ENST00000317151 4069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
POMPQ9Y244 PLEKHA4-201ENST00000263265 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
POMPQ9Y244 ERO1B-202ENST00000354619 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
POMPQ9Y244 TPO-201ENST00000329066 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
POMPQ9Y244 PBX3-203ENST00000373487 2902 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
POMPQ9Y244 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
POMPQ9Y244 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
POMPQ9Y244 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
POMPQ9Y244 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
POMPQ9Y244 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
POMPQ9Y244 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
POMPQ9Y244 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
POMPQ9Y244 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
POMPQ9Y244 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
POMPQ9Y244 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
POMPQ9Y244 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
POMPQ9Y244 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
POMPQ9Y244 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
POMPQ9Y244 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
POMPQ9Y244 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
POMPQ9Y244 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
POMPQ9Y244 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
POMPQ9Y244 PHF19-203ENST00000419155 3525 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
POMPQ9Y244 ANKLE2-210ENST00000542657 2446 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
POMPQ9Y244 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
POMPQ9Y244 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
POMPQ9Y244 ASIC4-201ENST00000347842 2684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
POMPQ9Y244 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
POMPQ9Y244 UNKL-201ENST00000248104 4320 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
POMPQ9Y244 OSBP2-201ENST00000332585 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.2 ms