Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJ41

RABGEF1, Rab5 GDP/GTP exchange factor, humanhuman

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Length 708 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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RABGEF1Q9UJ41 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RABGEF1Q9UJ41 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
RABGEF1Q9UJ41 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
RABGEF1Q9UJ41 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
RABGEF1Q9UJ41 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC16.62■□□□□ 0.25
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RABGEF1Q9UJ41 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
RABGEF1Q9UJ41 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
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RABGEF1Q9UJ41 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
RABGEF1Q9UJ41 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
RABGEF1Q9UJ41 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
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RABGEF1Q9UJ41 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
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RABGEF1Q9UJ41 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
RABGEF1Q9UJ41 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
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RABGEF1Q9UJ41 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RABGEF1Q9UJ41 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
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RABGEF1Q9UJ41 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
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RABGEF1Q9UJ41 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RABGEF1Q9UJ41 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
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RABGEF1Q9UJ41 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RABGEF1Q9UJ41 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
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RABGEF1Q9UJ41 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RABGEF1Q9UJ41 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RABGEF1Q9UJ41 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
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RABGEF1Q9UJ41 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
RABGEF1Q9UJ41 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RABGEF1Q9UJ41 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RABGEF1Q9UJ41 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RABGEF1Q9UJ41 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RABGEF1Q9UJ41 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RABGEF1Q9UJ41 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RABGEF1Q9UJ41 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RABGEF1Q9UJ41 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
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