Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0W5

SCHIP1, Schwannomin-interacting protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 487 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCHIP1Q9P0W5 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SCHIP1Q9P0W5 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SCHIP1Q9P0W5 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SCHIP1Q9P0W5 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SCHIP1Q9P0W5 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
SCHIP1Q9P0W5 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SCHIP1Q9P0W5 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SCHIP1Q9P0W5 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SCHIP1Q9P0W5 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SCHIP1Q9P0W5 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SCHIP1Q9P0W5 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
SCHIP1Q9P0W5 RIMS3-202ENST00000372684 7235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SCHIP1Q9P0W5 MAPT-204ENST00000344290 6816 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SCHIP1Q9P0W5 MLLT6-211ENST00000621332 7578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SCHIP1Q9P0W5 TLN1-201ENST00000314888 8823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SCHIP1Q9P0W5 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SCHIP1Q9P0W5 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SCHIP1Q9P0W5 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SCHIP1Q9P0W5 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SCHIP1Q9P0W5 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SCHIP1Q9P0W5 PIK3R1-211ENST00000521381 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SCHIP1Q9P0W5 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SCHIP1Q9P0W5 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SCHIP1Q9P0W5 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SCHIP1Q9P0W5 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SCHIP1Q9P0W5 UBR5-201ENST00000220959 9418 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SCHIP1Q9P0W5 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SCHIP1Q9P0W5 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SCHIP1Q9P0W5 E2F3-201ENST00000346618 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SCHIP1Q9P0W5 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SCHIP1Q9P0W5 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SCHIP1Q9P0W5 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SCHIP1Q9P0W5 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SCHIP1Q9P0W5 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SCHIP1Q9P0W5 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SCHIP1Q9P0W5 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SCHIP1Q9P0W5 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SCHIP1Q9P0W5 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SCHIP1Q9P0W5 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
SCHIP1Q9P0W5 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
SCHIP1Q9P0W5 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SCHIP1Q9P0W5 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SCHIP1Q9P0W5 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SCHIP1Q9P0W5 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SCHIP1Q9P0W5 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SCHIP1Q9P0W5 LATS2-201ENST00000382592 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SCHIP1Q9P0W5 SLC2A13-201ENST00000280871 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SCHIP1Q9P0W5 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SCHIP1Q9P0W5 GALNT16-202ENST00000448469 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SCHIP1Q9P0W5 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SCHIP1Q9P0W5 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SCHIP1Q9P0W5 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SCHIP1Q9P0W5 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SCHIP1Q9P0W5 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SCHIP1Q9P0W5 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SCHIP1Q9P0W5 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SCHIP1Q9P0W5 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SCHIP1Q9P0W5 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
SCHIP1Q9P0W5 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SCHIP1Q9P0W5 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SCHIP1Q9P0W5 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SCHIP1Q9P0W5 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SCHIP1Q9P0W5 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SCHIP1Q9P0W5 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SCHIP1Q9P0W5 GRIN2A-201ENST00000330684 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SCHIP1Q9P0W5 PAK4-208ENST00000599386 5735 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SCHIP1Q9P0W5 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SCHIP1Q9P0W5 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SCHIP1Q9P0W5 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SCHIP1Q9P0W5 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SCHIP1Q9P0W5 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SCHIP1Q9P0W5 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SCHIP1Q9P0W5 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SCHIP1Q9P0W5 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SCHIP1Q9P0W5 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SCHIP1Q9P0W5 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SCHIP1Q9P0W5 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SCHIP1Q9P0W5 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
SCHIP1Q9P0W5 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SCHIP1Q9P0W5 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SCHIP1Q9P0W5 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SCHIP1Q9P0W5 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SCHIP1Q9P0W5 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SCHIP1Q9P0W5 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SCHIP1Q9P0W5 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
SCHIP1Q9P0W5 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
SCHIP1Q9P0W5 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
SCHIP1Q9P0W5 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
SCHIP1Q9P0W5 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SCHIP1Q9P0W5 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SCHIP1Q9P0W5 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SCHIP1Q9P0W5 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
SCHIP1Q9P0W5 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SCHIP1Q9P0W5 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SCHIP1Q9P0W5 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SCHIP1Q9P0W5 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SCHIP1Q9P0W5 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SCHIP1Q9P0W5 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SCHIP1Q9P0W5 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SCHIP1Q9P0W5 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms