Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0J1

PDP1, [Pyruvate dehydrogenase [acetyl-transferring]]-phosphatase 1, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 537 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDP1Q9P0J1 DIXDC1-201ENST00000440460 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PDP1Q9P0J1 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PDP1Q9P0J1 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PDP1Q9P0J1 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PDP1Q9P0J1 SYBU-208ENST00000440310 3072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
PDP1Q9P0J1 LINC00937-207ENST00000544461 3033 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
PDP1Q9P0J1 PALLD-215ENST00000512127 2958 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
PDP1Q9P0J1 NOS1AP-201ENST00000361897 4931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PDP1Q9P0J1 RNASEH2B-202ENST00000422660 4830 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
PDP1Q9P0J1 SEMA5B-206ENST00000451055 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
PDP1Q9P0J1 AL009178.2-201ENST00000597278 2719 ntBASIC15.04■□□□□ -0
PDP1Q9P0J1 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PDP1Q9P0J1 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PDP1Q9P0J1 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PDP1Q9P0J1 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
PDP1Q9P0J1 AK4-202ENST00000395334 6998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PDP1Q9P0J1 IRGQ-201ENST00000422989 9685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
PDP1Q9P0J1 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
PDP1Q9P0J1 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
PDP1Q9P0J1 SLC36A1-207ENST00000520701 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
PDP1Q9P0J1 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
PDP1Q9P0J1 UBE3A-227ENST00000638011 8742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
PDP1Q9P0J1 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PDP1Q9P0J1 TBK1-201ENST00000331710 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PDP1Q9P0J1 APAF1-201ENST00000333991 4539 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
PDP1Q9P0J1 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
PDP1Q9P0J1 KCNC2-208ENST00000549446 5625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PDP1Q9P0J1 ATP2A3-204ENST00000397035 4182 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
PDP1Q9P0J1 ELMOD1-201ENST00000265840 2852 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PDP1Q9P0J1 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PDP1Q9P0J1 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PDP1Q9P0J1 GSPT1-202ENST00000434724 7105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PDP1Q9P0J1 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
PDP1Q9P0J1 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
PDP1Q9P0J1 USP43-202ENST00000570475 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PDP1Q9P0J1 LATS2-201ENST00000382592 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PDP1Q9P0J1 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PDP1Q9P0J1 ANOS1-201ENST00000262648 6314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PDP1Q9P0J1 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
PDP1Q9P0J1 CASC3-201ENST00000264645 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PDP1Q9P0J1 MEN1-207ENST00000377326 3150 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
PDP1Q9P0J1 ASAH1-210ENST00000520781 2245 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
PDP1Q9P0J1 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PDP1Q9P0J1 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PDP1Q9P0J1 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC15.03■□□□□ -0
PDP1Q9P0J1 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PDP1Q9P0J1 SLC24A3-201ENST00000328041 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PDP1Q9P0J1 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
PDP1Q9P0J1 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
PDP1Q9P0J1 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
PDP1Q9P0J1 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
PDP1Q9P0J1 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PDP1Q9P0J1 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
PDP1Q9P0J1 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
PDP1Q9P0J1 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
PDP1Q9P0J1 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
PDP1Q9P0J1 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
PDP1Q9P0J1 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
PDP1Q9P0J1 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
PDP1Q9P0J1 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC15.03■□□□□ -0
PDP1Q9P0J1 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PDP1Q9P0J1 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
PDP1Q9P0J1 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
PDP1Q9P0J1 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
PDP1Q9P0J1 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PDP1Q9P0J1 DYSF-201ENST00000258104 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PDP1Q9P0J1 DYSF-204ENST00000409582 6790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PDP1Q9P0J1 DYSF-210ENST00000413539 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PDP1Q9P0J1 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PDP1Q9P0J1 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PDP1Q9P0J1 LRCH1-202ENST00000389797 3314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PDP1Q9P0J1 CHDH-201ENST00000315251 7665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PDP1Q9P0J1 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PDP1Q9P0J1 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PDP1Q9P0J1 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
PDP1Q9P0J1 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PDP1Q9P0J1 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
PDP1Q9P0J1 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
PDP1Q9P0J1 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PDP1Q9P0J1 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PDP1Q9P0J1 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
PDP1Q9P0J1 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC15.02■□□□□ -0
PDP1Q9P0J1 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
PDP1Q9P0J1 ABI3-201ENST00000225941 2109 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PDP1Q9P0J1 TTC22-202ENST00000371276 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
PDP1Q9P0J1 COG3-201ENST00000349995 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PDP1Q9P0J1 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
PDP1Q9P0J1 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PDP1Q9P0J1 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PDP1Q9P0J1 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PDP1Q9P0J1 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PDP1Q9P0J1 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PDP1Q9P0J1 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
PDP1Q9P0J1 COL5A1-208ENST00000618395 8437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
PDP1Q9P0J1 SDK1-210ENST00000615806 10258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
PDP1Q9P0J1 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PDP1Q9P0J1 PTPRH-201ENST00000263434 3343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PDP1Q9P0J1 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PDP1Q9P0J1 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PDP1Q9P0J1 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.6 ms