Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0E4

GRIP2, Glutamate receptor-interacting protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,043 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIP2Q9C0E4 TMPRSS3-204ENST00000433957 2403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GRIP2Q9C0E4 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GRIP2Q9C0E4 USP35-203ENST00000529308 4216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GRIP2Q9C0E4 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GRIP2Q9C0E4 AC007191.1-201ENST00000623179 2995 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
GRIP2Q9C0E4 TPD52L2-202ENST00000346249 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GRIP2Q9C0E4 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GRIP2Q9C0E4 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GRIP2Q9C0E4 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GRIP2Q9C0E4 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GRIP2Q9C0E4 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GRIP2Q9C0E4 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GRIP2Q9C0E4 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GRIP2Q9C0E4 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GRIP2Q9C0E4 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
GRIP2Q9C0E4 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GRIP2Q9C0E4 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GRIP2Q9C0E4 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GRIP2Q9C0E4 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GRIP2Q9C0E4 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GRIP2Q9C0E4 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GRIP2Q9C0E4 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
GRIP2Q9C0E4 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GRIP2Q9C0E4 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GRIP2Q9C0E4 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GRIP2Q9C0E4 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GRIP2Q9C0E4 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
GRIP2Q9C0E4 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GRIP2Q9C0E4 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GRIP2Q9C0E4 BRCC3-201ENST00000330045 2496 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GRIP2Q9C0E4 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GRIP2Q9C0E4 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GRIP2Q9C0E4 ATP6V0A4-201ENST00000310018 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GRIP2Q9C0E4 IL9R-202ENST00000369423 2032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GRIP2Q9C0E4 UBXN2B-201ENST00000399598 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GRIP2Q9C0E4 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GRIP2Q9C0E4 MOCS1-201ENST00000340692 2747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GRIP2Q9C0E4 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GRIP2Q9C0E4 AP004608.1-203ENST00000528482 3679 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GRIP2Q9C0E4 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GRIP2Q9C0E4 KIF21A-202ENST00000361961 6601 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GRIP2Q9C0E4 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GRIP2Q9C0E4 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GRIP2Q9C0E4 AXL-202ENST00000359092 3206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GRIP2Q9C0E4 USP36-201ENST00000312010 5234 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GRIP2Q9C0E4 IRF4-201ENST00000380956 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GRIP2Q9C0E4 SIGLEC11-202ENST00000426971 2479 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GRIP2Q9C0E4 TRIM67-201ENST00000366653 3936 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GRIP2Q9C0E4 OPA1-208ENST00000392438 6340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GRIP2Q9C0E4 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GRIP2Q9C0E4 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GRIP2Q9C0E4 NCKIPSD-204ENST00000416649 2925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GRIP2Q9C0E4 KIFC3-207ENST00000543930 3018 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GRIP2Q9C0E4 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GRIP2Q9C0E4 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GRIP2Q9C0E4 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GRIP2Q9C0E4 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GRIP2Q9C0E4 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
GRIP2Q9C0E4 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GRIP2Q9C0E4 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GRIP2Q9C0E4 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
GRIP2Q9C0E4 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GRIP2Q9C0E4 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GRIP2Q9C0E4 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GRIP2Q9C0E4 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GRIP2Q9C0E4 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GRIP2Q9C0E4 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GRIP2Q9C0E4 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GRIP2Q9C0E4 TSEN2-205ENST00000444864 2697 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GRIP2Q9C0E4 MIR600HG-201ENST00000449175 5984 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
GRIP2Q9C0E4 BNIP2-201ENST00000267859 6325 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GRIP2Q9C0E4 SMARCA4-207ENST00000541122 5139 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GRIP2Q9C0E4 SLC13A5-203ENST00000433363 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GRIP2Q9C0E4 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GRIP2Q9C0E4 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GRIP2Q9C0E4 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GRIP2Q9C0E4 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
GRIP2Q9C0E4 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GRIP2Q9C0E4 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GRIP2Q9C0E4 ZHX1-201ENST00000297857 5200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GRIP2Q9C0E4 RNF222-202ENST00000399398 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GRIP2Q9C0E4 PCNX1-202ENST00000439984 6988 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GRIP2Q9C0E4 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GRIP2Q9C0E4 NID1-201ENST00000264187 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GRIP2Q9C0E4 KYAT1-205ENST00000436267 2487 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GRIP2Q9C0E4 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GRIP2Q9C0E4 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GRIP2Q9C0E4 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GRIP2Q9C0E4 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GRIP2Q9C0E4 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GRIP2Q9C0E4 LINC01250-201ENST00000457478 2344 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GRIP2Q9C0E4 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GRIP2Q9C0E4 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GRIP2Q9C0E4 TPGS2-201ENST00000334295 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GRIP2Q9C0E4 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GRIP2Q9C0E4 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GRIP2Q9C0E4 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GRIP2Q9C0E4 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
GRIP2Q9C0E4 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GRIP2Q9C0E4 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms