Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY41

HDAC8, Histone deacetylase 8, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC8Q9BY41 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HDAC8Q9BY41 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HDAC8Q9BY41 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HDAC8Q9BY41 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HDAC8Q9BY41 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HDAC8Q9BY41 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HDAC8Q9BY41 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HDAC8Q9BY41 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HDAC8Q9BY41 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HDAC8Q9BY41 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HDAC8Q9BY41 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HDAC8Q9BY41 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HDAC8Q9BY41 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HDAC8Q9BY41 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HDAC8Q9BY41 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HDAC8Q9BY41 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HDAC8Q9BY41 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HDAC8Q9BY41 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HDAC8Q9BY41 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HDAC8Q9BY41 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HDAC8Q9BY41 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HDAC8Q9BY41 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HDAC8Q9BY41 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HDAC8Q9BY41 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HDAC8Q9BY41 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HDAC8Q9BY41 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HDAC8Q9BY41 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HDAC8Q9BY41 C12orf10-201ENST00000267103 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HDAC8Q9BY41 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HDAC8Q9BY41 FOXR1-201ENST00000317011 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HDAC8Q9BY41 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HDAC8Q9BY41 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HDAC8Q9BY41 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HDAC8Q9BY41 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HDAC8Q9BY41 HHEX-203ENST00000492654 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HDAC8Q9BY41 LEPROTL1-204ENST00000518192 847 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HDAC8Q9BY41 OIP5-AS1-209ENST00000561226 775 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HDAC8Q9BY41 COMMD4-217ENST00000567195 677 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HDAC8Q9BY41 AC008770.3-202ENST00000591944 567 ntTSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HDAC8Q9BY41 FAM66A-202ENST00000602658 546 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HDAC8Q9BY41 SNHG28-203ENST00000621242 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HDAC8Q9BY41 AL031056.2-201ENST00000637957 1217 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HDAC8Q9BY41 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HDAC8Q9BY41 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HDAC8Q9BY41 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HDAC8Q9BY41 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HDAC8Q9BY41 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HDAC8Q9BY41 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HDAC8Q9BY41 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HDAC8Q9BY41 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HDAC8Q9BY41 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HDAC8Q9BY41 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HDAC8Q9BY41 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HDAC8Q9BY41 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HDAC8Q9BY41 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HDAC8Q9BY41 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HDAC8Q9BY41 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HDAC8Q9BY41 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HDAC8Q9BY41 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HDAC8Q9BY41 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HDAC8Q9BY41 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HDAC8Q9BY41 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HDAC8Q9BY41 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HDAC8Q9BY41 LCE3A-201ENST00000335674 270 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HDAC8Q9BY41 VHLL-201ENST00000339922 676 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HDAC8Q9BY41 CTRB1-201ENST00000361017 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HDAC8Q9BY41 NDUFB8-202ENST00000370320 684 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HDAC8Q9BY41 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HDAC8Q9BY41 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
HDAC8Q9BY41 Z98749.2-207ENST00000443658 679 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HDAC8Q9BY41 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HDAC8Q9BY41 C11orf98-202ENST00000525675 405 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HDAC8Q9BY41 TMEM218-210ENST00000529609 734 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HDAC8Q9BY41 AC079336.2-201ENST00000578408 927 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HDAC8Q9BY41 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HDAC8Q9BY41 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
HDAC8Q9BY41 TMEM261P1-201ENST00000604899 340 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
HDAC8Q9BY41 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HDAC8Q9BY41 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HDAC8Q9BY41 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HDAC8Q9BY41 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HDAC8Q9BY41 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HDAC8Q9BY41 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HDAC8Q9BY41 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HDAC8Q9BY41 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HDAC8Q9BY41 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HDAC8Q9BY41 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HDAC8Q9BY41 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HDAC8Q9BY41 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.14
HDAC8Q9BY41 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HDAC8Q9BY41 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HDAC8Q9BY41 KLK15-201ENST00000326856 1389 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HDAC8Q9BY41 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HDAC8Q9BY41 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HDAC8Q9BY41 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HDAC8Q9BY41 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HDAC8Q9BY41 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HDAC8Q9BY41 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HDAC8Q9BY41 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HDAC8Q9BY41 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms