Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXP2

SLC12A9, Solute carrier family 12 member 9, humanhuman

Predictions only

Length 914 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC12A9Q9BXP2 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLC12A9Q9BXP2 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLC12A9Q9BXP2 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLC12A9Q9BXP2 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLC12A9Q9BXP2 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLC12A9Q9BXP2 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLC12A9Q9BXP2 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
SLC12A9Q9BXP2 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
SLC12A9Q9BXP2 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
SLC12A9Q9BXP2 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
SLC12A9Q9BXP2 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
SLC12A9Q9BXP2 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
SLC12A9Q9BXP2 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
SLC12A9Q9BXP2 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
SLC12A9Q9BXP2 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SLC12A9Q9BXP2 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SLC12A9Q9BXP2 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SLC12A9Q9BXP2 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SLC12A9Q9BXP2 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SLC12A9Q9BXP2 RAC2-204ENST00000406508 893 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SLC12A9Q9BXP2 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SLC12A9Q9BXP2 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
SLC12A9Q9BXP2 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SLC12A9Q9BXP2 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SLC12A9Q9BXP2 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SLC12A9Q9BXP2 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SLC12A9Q9BXP2 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SLC12A9Q9BXP2 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SLC12A9Q9BXP2 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SLC12A9Q9BXP2 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SLC12A9Q9BXP2 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SLC12A9Q9BXP2 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SLC12A9Q9BXP2 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
SLC12A9Q9BXP2 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SLC12A9Q9BXP2 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SLC12A9Q9BXP2 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SLC12A9Q9BXP2 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SLC12A9Q9BXP2 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SLC12A9Q9BXP2 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SLC12A9Q9BXP2 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SLC12A9Q9BXP2 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SLC12A9Q9BXP2 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SLC12A9Q9BXP2 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SLC12A9Q9BXP2 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SLC12A9Q9BXP2 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SLC12A9Q9BXP2 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SLC12A9Q9BXP2 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SLC12A9Q9BXP2 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SLC12A9Q9BXP2 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SLC12A9Q9BXP2 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SLC12A9Q9BXP2 EDF1-203ENST00000371649 790 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SLC12A9Q9BXP2 GK-202ENST00000378941 458 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SLC12A9Q9BXP2 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SLC12A9Q9BXP2 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SLC12A9Q9BXP2 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
SLC12A9Q9BXP2 GAPDHP21-201ENST00000450301 1010 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
SLC12A9Q9BXP2 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SLC12A9Q9BXP2 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SLC12A9Q9BXP2 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SLC12A9Q9BXP2 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SLC12A9Q9BXP2 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
SLC12A9Q9BXP2 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SLC12A9Q9BXP2 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SLC12A9Q9BXP2 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SLC12A9Q9BXP2 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SLC12A9Q9BXP2 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SLC12A9Q9BXP2 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SLC12A9Q9BXP2 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SLC12A9Q9BXP2 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SLC12A9Q9BXP2 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SLC12A9Q9BXP2 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
SLC12A9Q9BXP2 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SLC12A9Q9BXP2 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SLC12A9Q9BXP2 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SLC12A9Q9BXP2 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SLC12A9Q9BXP2 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SLC12A9Q9BXP2 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SLC12A9Q9BXP2 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SLC12A9Q9BXP2 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SLC12A9Q9BXP2 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SLC12A9Q9BXP2 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SLC12A9Q9BXP2 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SLC12A9Q9BXP2 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SLC12A9Q9BXP2 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SLC12A9Q9BXP2 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SLC12A9Q9BXP2 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SLC12A9Q9BXP2 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SLC12A9Q9BXP2 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SLC12A9Q9BXP2 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SLC12A9Q9BXP2 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SLC12A9Q9BXP2 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SLC12A9Q9BXP2 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SLC12A9Q9BXP2 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SLC12A9Q9BXP2 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SLC12A9Q9BXP2 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SLC12A9Q9BXP2 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SLC12A9Q9BXP2 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
SLC12A9Q9BXP2 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SLC12A9Q9BXP2 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SLC12A9Q9BXP2 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.2 ms