Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVS4

RIOK2, Serine/threonine-protein kinase RIO2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 552 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIOK2Q9BVS4 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
RIOK2Q9BVS4 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RIOK2Q9BVS4 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RIOK2Q9BVS4 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RIOK2Q9BVS4 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RIOK2Q9BVS4 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RIOK2Q9BVS4 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RIOK2Q9BVS4 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RIOK2Q9BVS4 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RIOK2Q9BVS4 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RIOK2Q9BVS4 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RIOK2Q9BVS4 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RIOK2Q9BVS4 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RIOK2Q9BVS4 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
RIOK2Q9BVS4 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
RIOK2Q9BVS4 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
RIOK2Q9BVS4 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RIOK2Q9BVS4 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
RIOK2Q9BVS4 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RIOK2Q9BVS4 AQP6-203ENST00000551733 849 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RIOK2Q9BVS4 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RIOK2Q9BVS4 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RIOK2Q9BVS4 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RIOK2Q9BVS4 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RIOK2Q9BVS4 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RIOK2Q9BVS4 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RIOK2Q9BVS4 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RIOK2Q9BVS4 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RIOK2Q9BVS4 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RIOK2Q9BVS4 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RIOK2Q9BVS4 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RIOK2Q9BVS4 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RIOK2Q9BVS4 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RIOK2Q9BVS4 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RIOK2Q9BVS4 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
RIOK2Q9BVS4 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RIOK2Q9BVS4 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RIOK2Q9BVS4 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RIOK2Q9BVS4 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
RIOK2Q9BVS4 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RIOK2Q9BVS4 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RIOK2Q9BVS4 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RIOK2Q9BVS4 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RIOK2Q9BVS4 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RIOK2Q9BVS4 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RIOK2Q9BVS4 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RIOK2Q9BVS4 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RIOK2Q9BVS4 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RIOK2Q9BVS4 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RIOK2Q9BVS4 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RIOK2Q9BVS4 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RIOK2Q9BVS4 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RIOK2Q9BVS4 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RIOK2Q9BVS4 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RIOK2Q9BVS4 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RIOK2Q9BVS4 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RIOK2Q9BVS4 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RIOK2Q9BVS4 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RIOK2Q9BVS4 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RIOK2Q9BVS4 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RIOK2Q9BVS4 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RIOK2Q9BVS4 INGX-202ENST00000489074 768 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
RIOK2Q9BVS4 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RIOK2Q9BVS4 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RIOK2Q9BVS4 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RIOK2Q9BVS4 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
RIOK2Q9BVS4 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RIOK2Q9BVS4 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RIOK2Q9BVS4 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
RIOK2Q9BVS4 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RIOK2Q9BVS4 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RIOK2Q9BVS4 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RIOK2Q9BVS4 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RIOK2Q9BVS4 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RIOK2Q9BVS4 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RIOK2Q9BVS4 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RIOK2Q9BVS4 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RIOK2Q9BVS4 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RIOK2Q9BVS4 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RIOK2Q9BVS4 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
RIOK2Q9BVS4 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RIOK2Q9BVS4 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RIOK2Q9BVS4 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RIOK2Q9BVS4 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RIOK2Q9BVS4 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RIOK2Q9BVS4 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RIOK2Q9BVS4 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RIOK2Q9BVS4 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RIOK2Q9BVS4 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RIOK2Q9BVS4 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RIOK2Q9BVS4 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RIOK2Q9BVS4 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RIOK2Q9BVS4 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RIOK2Q9BVS4 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RIOK2Q9BVS4 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RIOK2Q9BVS4 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RIOK2Q9BVS4 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RIOK2Q9BVS4 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RIOK2Q9BVS4 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
RIOK2Q9BVS4 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.5 ms